Protein–RNA interactions for Protein: Q3UT54

Obox3, Oocyte-specific homeobox 3, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Obox3Q3UT54 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Obox3Q3UT54 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Obox3Q3UT54 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Obox3Q3UT54 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Obox3Q3UT54 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Obox3Q3UT54 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Obox3Q3UT54 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Obox3Q3UT54 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Obox3Q3UT54 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Obox3Q3UT54 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Obox3Q3UT54 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Obox3Q3UT54 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Obox3Q3UT54 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Obox3Q3UT54 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Obox3Q3UT54 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Obox3Q3UT54 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Obox3Q3UT54 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Obox3Q3UT54 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Obox3Q3UT54 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Obox3Q3UT54 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Obox3Q3UT54 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Obox3Q3UT54 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Obox3Q3UT54 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Obox3Q3UT54 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Obox3Q3UT54 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Obox3Q3UT54 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Obox3Q3UT54 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Obox3Q3UT54 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Obox3Q3UT54 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Obox3Q3UT54 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Obox3Q3UT54 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Obox3Q3UT54 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Obox3Q3UT54 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Obox3Q3UT54 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Obox3Q3UT54 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Obox3Q3UT54 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Obox3Q3UT54 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Obox3Q3UT54 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Obox3Q3UT54 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Obox3Q3UT54 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Obox3Q3UT54 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Obox3Q3UT54 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Obox3Q3UT54 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Obox3Q3UT54 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Obox3Q3UT54 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Obox3Q3UT54 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Obox3Q3UT54 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Obox3Q3UT54 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Obox3Q3UT54 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Obox3Q3UT54 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Obox3Q3UT54 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Obox3Q3UT54 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Obox3Q3UT54 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Obox3Q3UT54 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Obox3Q3UT54 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Obox3Q3UT54 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Obox3Q3UT54 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Obox3Q3UT54 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Obox3Q3UT54 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Obox3Q3UT54 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Obox3Q3UT54 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Obox3Q3UT54 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Obox3Q3UT54 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Obox3Q3UT54 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Obox3Q3UT54 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Obox3Q3UT54 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Obox3Q3UT54 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Obox3Q3UT54 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Obox3Q3UT54 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Obox3Q3UT54 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Obox3Q3UT54 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Obox3Q3UT54 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Obox3Q3UT54 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Obox3Q3UT54 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Obox3Q3UT54 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Obox3Q3UT54 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Obox3Q3UT54 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Obox3Q3UT54 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Obox3Q3UT54 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Obox3Q3UT54 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Obox3Q3UT54 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Obox3Q3UT54 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Obox3Q3UT54 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Obox3Q3UT54 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Obox3Q3UT54 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Obox3Q3UT54 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Obox3Q3UT54 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Obox3Q3UT54 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
Obox3Q3UT54 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Obox3Q3UT54 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Obox3Q3UT54 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Obox3Q3UT54 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Obox3Q3UT54 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Obox3Q3UT54 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Obox3Q3UT54 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Obox3Q3UT54 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Obox3Q3UT54 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Obox3Q3UT54 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Obox3Q3UT54 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Obox3Q3UT54 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.8 ms