Protein–RNA interactions for Protein: Q05A06

Vmn1r236, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r236Q05A06 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vmn1r236Q05A06 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vmn1r236Q05A06 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vmn1r236Q05A06 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Vmn1r236Q05A06 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Vmn1r236Q05A06 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vmn1r236Q05A06 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vmn1r236Q05A06 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vmn1r236Q05A06 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vmn1r236Q05A06 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vmn1r236Q05A06 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vmn1r236Q05A06 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vmn1r236Q05A06 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Vmn1r236Q05A06 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vmn1r236Q05A06 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vmn1r236Q05A06 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vmn1r236Q05A06 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vmn1r236Q05A06 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vmn1r236Q05A06 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vmn1r236Q05A06 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vmn1r236Q05A06 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vmn1r236Q05A06 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vmn1r236Q05A06 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vmn1r236Q05A06 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vmn1r236Q05A06 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vmn1r236Q05A06 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vmn1r236Q05A06 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vmn1r236Q05A06 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vmn1r236Q05A06 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vmn1r236Q05A06 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vmn1r236Q05A06 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Vmn1r236Q05A06 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vmn1r236Q05A06 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vmn1r236Q05A06 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vmn1r236Q05A06 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vmn1r236Q05A06 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vmn1r236Q05A06 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vmn1r236Q05A06 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vmn1r236Q05A06 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vmn1r236Q05A06 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vmn1r236Q05A06 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vmn1r236Q05A06 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vmn1r236Q05A06 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vmn1r236Q05A06 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vmn1r236Q05A06 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vmn1r236Q05A06 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vmn1r236Q05A06 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vmn1r236Q05A06 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vmn1r236Q05A06 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Vmn1r236Q05A06 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vmn1r236Q05A06 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vmn1r236Q05A06 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vmn1r236Q05A06 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vmn1r236Q05A06 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vmn1r236Q05A06 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vmn1r236Q05A06 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vmn1r236Q05A06 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vmn1r236Q05A06 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vmn1r236Q05A06 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vmn1r236Q05A06 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vmn1r236Q05A06 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vmn1r236Q05A06 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vmn1r236Q05A06 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vmn1r236Q05A06 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vmn1r236Q05A06 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Vmn1r236Q05A06 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vmn1r236Q05A06 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Vmn1r236Q05A06 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Vmn1r236Q05A06 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vmn1r236Q05A06 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vmn1r236Q05A06 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vmn1r236Q05A06 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vmn1r236Q05A06 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Vmn1r236Q05A06 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vmn1r236Q05A06 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Vmn1r236Q05A06 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vmn1r236Q05A06 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vmn1r236Q05A06 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vmn1r236Q05A06 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vmn1r236Q05A06 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vmn1r236Q05A06 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vmn1r236Q05A06 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vmn1r236Q05A06 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vmn1r236Q05A06 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vmn1r236Q05A06 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vmn1r236Q05A06 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vmn1r236Q05A06 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vmn1r236Q05A06 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vmn1r236Q05A06 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vmn1r236Q05A06 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Vmn1r236Q05A06 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vmn1r236Q05A06 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vmn1r236Q05A06 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vmn1r236Q05A06 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Vmn1r236Q05A06 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vmn1r236Q05A06 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vmn1r236Q05A06 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Vmn1r236Q05A06 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Vmn1r236Q05A06 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vmn1r236Q05A06 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 142.1 ms