Protein–RNA interactions for Protein: Q00420

Gabpb1, GA-binding protein subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb1Q00420 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Gabpb1Q00420 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Gabpb1Q00420 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Gabpb1Q00420 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Gabpb1Q00420 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Gabpb1Q00420 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Gabpb1Q00420 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Gabpb1Q00420 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Gabpb1Q00420 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Gabpb1Q00420 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Gabpb1Q00420 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Gabpb1Q00420 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Gabpb1Q00420 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Gabpb1Q00420 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Gabpb1Q00420 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Gabpb1Q00420 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Gabpb1Q00420 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Gabpb1Q00420 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Gabpb1Q00420 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Gabpb1Q00420 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Gabpb1Q00420 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Gabpb1Q00420 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Gabpb1Q00420 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Gabpb1Q00420 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Gabpb1Q00420 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Gabpb1Q00420 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Gabpb1Q00420 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Gabpb1Q00420 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Gabpb1Q00420 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Gabpb1Q00420 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Gabpb1Q00420 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Gabpb1Q00420 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Gabpb1Q00420 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Gabpb1Q00420 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Gabpb1Q00420 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Gabpb1Q00420 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Gabpb1Q00420 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Gabpb1Q00420 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Gabpb1Q00420 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
Gabpb1Q00420 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Gabpb1Q00420 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Gabpb1Q00420 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Gabpb1Q00420 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Gabpb1Q00420 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Gabpb1Q00420 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Gabpb1Q00420 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Gabpb1Q00420 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Gabpb1Q00420 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Gabpb1Q00420 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Gabpb1Q00420 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Gabpb1Q00420 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Gabpb1Q00420 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Gabpb1Q00420 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Gabpb1Q00420 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Gabpb1Q00420 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Gabpb1Q00420 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Gabpb1Q00420 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Gabpb1Q00420 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Gabpb1Q00420 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Gabpb1Q00420 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Gabpb1Q00420 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Gabpb1Q00420 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Gabpb1Q00420 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Gabpb1Q00420 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Gabpb1Q00420 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Gabpb1Q00420 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Gabpb1Q00420 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Gabpb1Q00420 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Gabpb1Q00420 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Gabpb1Q00420 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Gabpb1Q00420 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Gabpb1Q00420 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Gabpb1Q00420 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Gabpb1Q00420 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Gabpb1Q00420 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Gabpb1Q00420 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Gabpb1Q00420 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Gabpb1Q00420 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Gabpb1Q00420 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Gabpb1Q00420 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
Gabpb1Q00420 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Gabpb1Q00420 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Gabpb1Q00420 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Gabpb1Q00420 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Gabpb1Q00420 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Gabpb1Q00420 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Gabpb1Q00420 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Gabpb1Q00420 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Gabpb1Q00420 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Gabpb1Q00420 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Gabpb1Q00420 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Gabpb1Q00420 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Gabpb1Q00420 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Gabpb1Q00420 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Gabpb1Q00420 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Gabpb1Q00420 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Gabpb1Q00420 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Gabpb1Q00420 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Gabpb1Q00420 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Gabpb1Q00420 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms