Protein–RNA interactions for Protein: P97376

Frg1, Protein FRG1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frg1P97376 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Frg1P97376 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Frg1P97376 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Frg1P97376 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Frg1P97376 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Frg1P97376 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Frg1P97376 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Frg1P97376 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Frg1P97376 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Frg1P97376 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Frg1P97376 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Frg1P97376 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Frg1P97376 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Frg1P97376 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Frg1P97376 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Frg1P97376 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Frg1P97376 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Frg1P97376 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Frg1P97376 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Frg1P97376 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Frg1P97376 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Frg1P97376 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Frg1P97376 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Frg1P97376 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Frg1P97376 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Frg1P97376 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Frg1P97376 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Frg1P97376 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Frg1P97376 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Frg1P97376 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Frg1P97376 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Frg1P97376 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Frg1P97376 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Frg1P97376 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Frg1P97376 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Frg1P97376 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Frg1P97376 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Frg1P97376 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Frg1P97376 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Frg1P97376 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Frg1P97376 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Frg1P97376 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Frg1P97376 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Frg1P97376 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Frg1P97376 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Frg1P97376 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Frg1P97376 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Frg1P97376 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Frg1P97376 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Frg1P97376 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Frg1P97376 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Frg1P97376 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Frg1P97376 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Frg1P97376 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Frg1P97376 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Frg1P97376 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Frg1P97376 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Frg1P97376 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Frg1P97376 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Frg1P97376 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Frg1P97376 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Frg1P97376 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Frg1P97376 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Frg1P97376 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Frg1P97376 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Frg1P97376 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Frg1P97376 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Frg1P97376 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Frg1P97376 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Frg1P97376 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Frg1P97376 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Frg1P97376 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Frg1P97376 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Frg1P97376 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Frg1P97376 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Frg1P97376 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Frg1P97376 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Frg1P97376 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Frg1P97376 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Frg1P97376 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Frg1P97376 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Frg1P97376 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Frg1P97376 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Frg1P97376 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Frg1P97376 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Frg1P97376 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Frg1P97376 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Frg1P97376 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Frg1P97376 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Frg1P97376 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Frg1P97376 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Frg1P97376 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Frg1P97376 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Frg1P97376 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Frg1P97376 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Frg1P97376 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Frg1P97376 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Frg1P97376 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Frg1P97376 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Frg1P97376 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms