Protein–RNA interactions for Protein: P70689

Gjb6, Gap junction beta-6 protein, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb6P70689 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Gjb6P70689 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Gjb6P70689 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Gjb6P70689 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Gjb6P70689 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Gjb6P70689 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Gjb6P70689 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Gjb6P70689 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Gjb6P70689 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Gjb6P70689 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Gjb6P70689 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Gjb6P70689 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Gjb6P70689 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Gjb6P70689 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Gjb6P70689 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Gjb6P70689 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Gjb6P70689 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Gjb6P70689 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Gjb6P70689 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Gjb6P70689 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Gjb6P70689 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Gjb6P70689 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Gjb6P70689 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Gjb6P70689 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
Gjb6P70689 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Gjb6P70689 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Gjb6P70689 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Gjb6P70689 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
Gjb6P70689 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
Gjb6P70689 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Gjb6P70689 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Gjb6P70689 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Gjb6P70689 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Gjb6P70689 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Gjb6P70689 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Gjb6P70689 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Gjb6P70689 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Gjb6P70689 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Gjb6P70689 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Gjb6P70689 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Gjb6P70689 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Gjb6P70689 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Gjb6P70689 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Gjb6P70689 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Gjb6P70689 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Gjb6P70689 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Gjb6P70689 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Gjb6P70689 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Gjb6P70689 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Gjb6P70689 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Gjb6P70689 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Gjb6P70689 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Gjb6P70689 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Gjb6P70689 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Gjb6P70689 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Gjb6P70689 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Gjb6P70689 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Gjb6P70689 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Gjb6P70689 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Gjb6P70689 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Gjb6P70689 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Gjb6P70689 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Gjb6P70689 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Gjb6P70689 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Gjb6P70689 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Gjb6P70689 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Gjb6P70689 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Gjb6P70689 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Gjb6P70689 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Gjb6P70689 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Gjb6P70689 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Gjb6P70689 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Gjb6P70689 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Gjb6P70689 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Gjb6P70689 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Gjb6P70689 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Gjb6P70689 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Gjb6P70689 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Gjb6P70689 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Gjb6P70689 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Gjb6P70689 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Gjb6P70689 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Gjb6P70689 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Gjb6P70689 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Gjb6P70689 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Gjb6P70689 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Gjb6P70689 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Gjb6P70689 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Gjb6P70689 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Gjb6P70689 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Gjb6P70689 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Gjb6P70689 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Gjb6P70689 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Gjb6P70689 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Gjb6P70689 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Gjb6P70689 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Gjb6P70689 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Gjb6P70689 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Gjb6P70689 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Gjb6P70689 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.5 ms