Protein–RNA interactions for Protein: P62835

Rap1a, Ras-related protein Rap-1A, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rap1aP62835 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rap1aP62835 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rap1aP62835 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rap1aP62835 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rap1aP62835 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rap1aP62835 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rap1aP62835 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rap1aP62835 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Rap1aP62835 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rap1aP62835 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rap1aP62835 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rap1aP62835 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rap1aP62835 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rap1aP62835 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rap1aP62835 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rap1aP62835 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rap1aP62835 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rap1aP62835 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Rap1aP62835 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rap1aP62835 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Rap1aP62835 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rap1aP62835 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rap1aP62835 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rap1aP62835 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rap1aP62835 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rap1aP62835 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rap1aP62835 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rap1aP62835 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rap1aP62835 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rap1aP62835 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Rap1aP62835 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rap1aP62835 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rap1aP62835 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rap1aP62835 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rap1aP62835 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rap1aP62835 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rap1aP62835 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rap1aP62835 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rap1aP62835 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rap1aP62835 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rap1aP62835 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rap1aP62835 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rap1aP62835 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rap1aP62835 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rap1aP62835 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Rap1aP62835 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Rap1aP62835 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rap1aP62835 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rap1aP62835 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rap1aP62835 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Rap1aP62835 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rap1aP62835 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rap1aP62835 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rap1aP62835 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rap1aP62835 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rap1aP62835 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rap1aP62835 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rap1aP62835 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rap1aP62835 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rap1aP62835 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rap1aP62835 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rap1aP62835 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rap1aP62835 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rap1aP62835 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rap1aP62835 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rap1aP62835 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rap1aP62835 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rap1aP62835 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Rap1aP62835 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rap1aP62835 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rap1aP62835 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rap1aP62835 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rap1aP62835 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rap1aP62835 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Rap1aP62835 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rap1aP62835 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rap1aP62835 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rap1aP62835 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Rap1aP62835 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rap1aP62835 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rap1aP62835 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Rap1aP62835 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rap1aP62835 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rap1aP62835 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Rap1aP62835 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rap1aP62835 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rap1aP62835 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rap1aP62835 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rap1aP62835 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Rap1aP62835 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rap1aP62835 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rap1aP62835 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rap1aP62835 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rap1aP62835 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Rap1aP62835 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rap1aP62835 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rap1aP62835 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rap1aP62835 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Rap1aP62835 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rap1aP62835 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms