Protein–RNA interactions for Protein: P62751

Rpl23a, 60S ribosomal protein L23a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl23aP62751 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rpl23aP62751 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Rpl23aP62751 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rpl23aP62751 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rpl23aP62751 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rpl23aP62751 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rpl23aP62751 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rpl23aP62751 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rpl23aP62751 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rpl23aP62751 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rpl23aP62751 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rpl23aP62751 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rpl23aP62751 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rpl23aP62751 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rpl23aP62751 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rpl23aP62751 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rpl23aP62751 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rpl23aP62751 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rpl23aP62751 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rpl23aP62751 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rpl23aP62751 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rpl23aP62751 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rpl23aP62751 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Rpl23aP62751 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rpl23aP62751 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rpl23aP62751 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rpl23aP62751 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rpl23aP62751 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rpl23aP62751 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Rpl23aP62751 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rpl23aP62751 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rpl23aP62751 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rpl23aP62751 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rpl23aP62751 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rpl23aP62751 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rpl23aP62751 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rpl23aP62751 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rpl23aP62751 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rpl23aP62751 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rpl23aP62751 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rpl23aP62751 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rpl23aP62751 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Rpl23aP62751 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Rpl23aP62751 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rpl23aP62751 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rpl23aP62751 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rpl23aP62751 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rpl23aP62751 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rpl23aP62751 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rpl23aP62751 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rpl23aP62751 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rpl23aP62751 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Rpl23aP62751 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rpl23aP62751 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rpl23aP62751 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Rpl23aP62751 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rpl23aP62751 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rpl23aP62751 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rpl23aP62751 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rpl23aP62751 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rpl23aP62751 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rpl23aP62751 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rpl23aP62751 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rpl23aP62751 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Rpl23aP62751 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rpl23aP62751 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rpl23aP62751 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Rpl23aP62751 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rpl23aP62751 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rpl23aP62751 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rpl23aP62751 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rpl23aP62751 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Rpl23aP62751 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rpl23aP62751 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rpl23aP62751 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rpl23aP62751 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rpl23aP62751 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rpl23aP62751 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rpl23aP62751 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rpl23aP62751 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rpl23aP62751 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rpl23aP62751 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rpl23aP62751 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rpl23aP62751 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rpl23aP62751 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rpl23aP62751 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rpl23aP62751 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Rpl23aP62751 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rpl23aP62751 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rpl23aP62751 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rpl23aP62751 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rpl23aP62751 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Rpl23aP62751 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rpl23aP62751 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rpl23aP62751 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rpl23aP62751 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rpl23aP62751 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rpl23aP62751 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Rpl23aP62751 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rpl23aP62751 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1315.4 ms