Protein–RNA interactions for Protein: P62320

Snrpd3, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd3P62320 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Snrpd3P62320 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Snrpd3P62320 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Snrpd3P62320 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Snrpd3P62320 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Snrpd3P62320 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Snrpd3P62320 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Snrpd3P62320 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Snrpd3P62320 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Snrpd3P62320 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Snrpd3P62320 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Snrpd3P62320 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Snrpd3P62320 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Snrpd3P62320 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Snrpd3P62320 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Snrpd3P62320 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Snrpd3P62320 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Snrpd3P62320 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Snrpd3P62320 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Snrpd3P62320 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snrpd3P62320 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Snrpd3P62320 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Snrpd3P62320 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snrpd3P62320 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snrpd3P62320 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Snrpd3P62320 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Snrpd3P62320 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Snrpd3P62320 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Snrpd3P62320 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Snrpd3P62320 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Snrpd3P62320 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Snrpd3P62320 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Snrpd3P62320 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Snrpd3P62320 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Snrpd3P62320 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Snrpd3P62320 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Snrpd3P62320 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Snrpd3P62320 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Snrpd3P62320 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Snrpd3P62320 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Snrpd3P62320 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Snrpd3P62320 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Snrpd3P62320 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Snrpd3P62320 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Snrpd3P62320 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Snrpd3P62320 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Snrpd3P62320 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snrpd3P62320 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Snrpd3P62320 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Snrpd3P62320 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Snrpd3P62320 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Snrpd3P62320 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Snrpd3P62320 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Snrpd3P62320 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Snrpd3P62320 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Snrpd3P62320 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Snrpd3P62320 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Snrpd3P62320 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Snrpd3P62320 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Snrpd3P62320 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Snrpd3P62320 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Snrpd3P62320 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Snrpd3P62320 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Snrpd3P62320 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Snrpd3P62320 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Snrpd3P62320 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Snrpd3P62320 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Snrpd3P62320 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Snrpd3P62320 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Snrpd3P62320 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Snrpd3P62320 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Snrpd3P62320 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Snrpd3P62320 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Snrpd3P62320 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Snrpd3P62320 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Snrpd3P62320 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Snrpd3P62320 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Snrpd3P62320 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Snrpd3P62320 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Snrpd3P62320 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Snrpd3P62320 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Snrpd3P62320 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Snrpd3P62320 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Snrpd3P62320 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Snrpd3P62320 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Snrpd3P62320 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Snrpd3P62320 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Snrpd3P62320 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Snrpd3P62320 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Snrpd3P62320 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Snrpd3P62320 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Snrpd3P62320 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Snrpd3P62320 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Snrpd3P62320 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Snrpd3P62320 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Snrpd3P62320 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Snrpd3P62320 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Snrpd3P62320 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Snrpd3P62320 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Snrpd3P62320 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 118.7 ms