Protein–RNA interactions for Protein: P56528

Cd38, ADP-ribosyl cyclase/cyclic ADP-ribose hydrolase 1, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd38P56528 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cd38P56528 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cd38P56528 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cd38P56528 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cd38P56528 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cd38P56528 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cd38P56528 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cd38P56528 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cd38P56528 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cd38P56528 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cd38P56528 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cd38P56528 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cd38P56528 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cd38P56528 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Cd38P56528 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cd38P56528 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cd38P56528 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cd38P56528 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cd38P56528 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cd38P56528 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cd38P56528 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cd38P56528 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cd38P56528 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Cd38P56528 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cd38P56528 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cd38P56528 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cd38P56528 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Cd38P56528 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cd38P56528 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Cd38P56528 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cd38P56528 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cd38P56528 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cd38P56528 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cd38P56528 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cd38P56528 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cd38P56528 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cd38P56528 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cd38P56528 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cd38P56528 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cd38P56528 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cd38P56528 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cd38P56528 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cd38P56528 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cd38P56528 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Cd38P56528 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cd38P56528 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cd38P56528 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cd38P56528 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cd38P56528 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cd38P56528 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Cd38P56528 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cd38P56528 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cd38P56528 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cd38P56528 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cd38P56528 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cd38P56528 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cd38P56528 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cd38P56528 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cd38P56528 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cd38P56528 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cd38P56528 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cd38P56528 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cd38P56528 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cd38P56528 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cd38P56528 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cd38P56528 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Cd38P56528 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cd38P56528 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cd38P56528 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cd38P56528 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cd38P56528 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cd38P56528 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cd38P56528 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cd38P56528 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cd38P56528 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cd38P56528 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cd38P56528 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cd38P56528 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Cd38P56528 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cd38P56528 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cd38P56528 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cd38P56528 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cd38P56528 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cd38P56528 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Cd38P56528 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cd38P56528 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cd38P56528 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cd38P56528 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cd38P56528 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cd38P56528 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cd38P56528 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cd38P56528 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cd38P56528 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Cd38P56528 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cd38P56528 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cd38P56528 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cd38P56528 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cd38P56528 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Cd38P56528 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cd38P56528 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.7 ms