Protein–RNA interactions for Protein: P49222

Epb42, Erythrocyte membrane protein band 4.2, mousemouse

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb42P49222 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Epb42P49222 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Epb42P49222 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Epb42P49222 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Epb42P49222 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Epb42P49222 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Epb42P49222 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Epb42P49222 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Epb42P49222 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Epb42P49222 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Epb42P49222 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Epb42P49222 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Epb42P49222 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Epb42P49222 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Epb42P49222 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Epb42P49222 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Epb42P49222 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Epb42P49222 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Epb42P49222 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Epb42P49222 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Epb42P49222 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Epb42P49222 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Epb42P49222 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Epb42P49222 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Epb42P49222 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Epb42P49222 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Epb42P49222 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Epb42P49222 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Epb42P49222 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Epb42P49222 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Epb42P49222 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Epb42P49222 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Epb42P49222 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Epb42P49222 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Epb42P49222 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Epb42P49222 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Epb42P49222 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Epb42P49222 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Epb42P49222 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Epb42P49222 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Epb42P49222 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Epb42P49222 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Epb42P49222 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Epb42P49222 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Epb42P49222 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Epb42P49222 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Epb42P49222 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Epb42P49222 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Epb42P49222 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Epb42P49222 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Epb42P49222 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Epb42P49222 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Epb42P49222 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Epb42P49222 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Epb42P49222 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Epb42P49222 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Epb42P49222 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Epb42P49222 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Epb42P49222 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Epb42P49222 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Epb42P49222 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Epb42P49222 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Epb42P49222 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Epb42P49222 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Epb42P49222 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Epb42P49222 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Epb42P49222 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Epb42P49222 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Epb42P49222 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Epb42P49222 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Epb42P49222 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Epb42P49222 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Epb42P49222 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Epb42P49222 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Epb42P49222 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Epb42P49222 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Epb42P49222 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Epb42P49222 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Epb42P49222 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Epb42P49222 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Epb42P49222 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Epb42P49222 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Epb42P49222 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Epb42P49222 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Epb42P49222 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Epb42P49222 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Epb42P49222 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Epb42P49222 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Epb42P49222 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Epb42P49222 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Epb42P49222 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Epb42P49222 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Epb42P49222 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Epb42P49222 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Epb42P49222 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Epb42P49222 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Epb42P49222 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Epb42P49222 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Epb42P49222 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Epb42P49222 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms