Protein–RNA interactions for Protein: P17563

Selenbp1, Selenium-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Selenbp1P17563 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Selenbp1P17563 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Selenbp1P17563 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Selenbp1P17563 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Selenbp1P17563 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Selenbp1P17563 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Selenbp1P17563 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Selenbp1P17563 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Selenbp1P17563 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Selenbp1P17563 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Selenbp1P17563 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Selenbp1P17563 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Selenbp1P17563 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Selenbp1P17563 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Selenbp1P17563 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Selenbp1P17563 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Selenbp1P17563 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Selenbp1P17563 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Selenbp1P17563 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Selenbp1P17563 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Selenbp1P17563 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Selenbp1P17563 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Selenbp1P17563 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Selenbp1P17563 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Selenbp1P17563 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Selenbp1P17563 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Selenbp1P17563 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Selenbp1P17563 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Selenbp1P17563 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Selenbp1P17563 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Selenbp1P17563 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Selenbp1P17563 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Selenbp1P17563 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Selenbp1P17563 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Selenbp1P17563 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Selenbp1P17563 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Selenbp1P17563 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Selenbp1P17563 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Selenbp1P17563 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Selenbp1P17563 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Selenbp1P17563 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Selenbp1P17563 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Selenbp1P17563 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Selenbp1P17563 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Selenbp1P17563 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Selenbp1P17563 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Selenbp1P17563 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Selenbp1P17563 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Selenbp1P17563 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Selenbp1P17563 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Selenbp1P17563 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Selenbp1P17563 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Selenbp1P17563 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Selenbp1P17563 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Selenbp1P17563 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Selenbp1P17563 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Selenbp1P17563 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Selenbp1P17563 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Selenbp1P17563 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Selenbp1P17563 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Selenbp1P17563 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Selenbp1P17563 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Selenbp1P17563 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Selenbp1P17563 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Selenbp1P17563 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Selenbp1P17563 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Selenbp1P17563 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Selenbp1P17563 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Selenbp1P17563 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Selenbp1P17563 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Selenbp1P17563 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Selenbp1P17563 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Selenbp1P17563 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Selenbp1P17563 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Selenbp1P17563 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Selenbp1P17563 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Selenbp1P17563 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Selenbp1P17563 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Selenbp1P17563 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Selenbp1P17563 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Selenbp1P17563 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Selenbp1P17563 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Selenbp1P17563 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Selenbp1P17563 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Selenbp1P17563 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Selenbp1P17563 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Selenbp1P17563 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Selenbp1P17563 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Selenbp1P17563 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Selenbp1P17563 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Selenbp1P17563 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Selenbp1P17563 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Selenbp1P17563 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Selenbp1P17563 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Selenbp1P17563 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Selenbp1P17563 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Selenbp1P17563 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Selenbp1P17563 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Selenbp1P17563 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Selenbp1P17563 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms