Protein–RNA interactions for Protein: P16951

Atf2, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 487 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf2P16951 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Atf2P16951 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Atf2P16951 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Atf2P16951 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Atf2P16951 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Atf2P16951 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Atf2P16951 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Atf2P16951 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Atf2P16951 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Atf2P16951 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Atf2P16951 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Atf2P16951 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Atf2P16951 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Atf2P16951 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Atf2P16951 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Atf2P16951 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Atf2P16951 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Atf2P16951 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Atf2P16951 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Atf2P16951 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Atf2P16951 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Atf2P16951 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Atf2P16951 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Atf2P16951 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Atf2P16951 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Atf2P16951 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Atf2P16951 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Atf2P16951 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Atf2P16951 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Atf2P16951 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Atf2P16951 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Atf2P16951 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Atf2P16951 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Atf2P16951 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Atf2P16951 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Atf2P16951 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Atf2P16951 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Atf2P16951 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Atf2P16951 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Atf2P16951 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Atf2P16951 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Atf2P16951 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Atf2P16951 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Atf2P16951 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Atf2P16951 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Atf2P16951 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Atf2P16951 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Atf2P16951 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Atf2P16951 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Atf2P16951 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Atf2P16951 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Atf2P16951 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Atf2P16951 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Atf2P16951 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Atf2P16951 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Atf2P16951 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Atf2P16951 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Atf2P16951 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Atf2P16951 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Atf2P16951 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Atf2P16951 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Atf2P16951 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Atf2P16951 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Atf2P16951 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Atf2P16951 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Atf2P16951 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Atf2P16951 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Atf2P16951 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Atf2P16951 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Atf2P16951 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Atf2P16951 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Atf2P16951 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Atf2P16951 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Atf2P16951 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Atf2P16951 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Atf2P16951 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Atf2P16951 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Atf2P16951 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Atf2P16951 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Atf2P16951 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Atf2P16951 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Atf2P16951 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Atf2P16951 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Atf2P16951 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Atf2P16951 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Atf2P16951 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Atf2P16951 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Atf2P16951 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Atf2P16951 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Atf2P16951 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Atf2P16951 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Atf2P16951 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Atf2P16951 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Atf2P16951 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Atf2P16951 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Atf2P16951 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Atf2P16951 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Atf2P16951 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Atf2P16951 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Atf2P16951 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms