Protein–RNA interactions for Protein: P13346

Fosb, Protein fosB, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FosbP13346 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
FosbP13346 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
FosbP13346 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
FosbP13346 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
FosbP13346 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
FosbP13346 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC32.04■■■□□ 2.72
FosbP13346 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
FosbP13346 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
FosbP13346 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
FosbP13346 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC31.91■■■□□ 2.7
FosbP13346 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
FosbP13346 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
FosbP13346 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
FosbP13346 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
FosbP13346 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
FosbP13346 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
FosbP13346 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
FosbP13346 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
FosbP13346 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC31.66■■■□□ 2.66
FosbP13346 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC31.65■■■□□ 2.66
FosbP13346 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
FosbP13346 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
FosbP13346 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
FosbP13346 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
FosbP13346 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
FosbP13346 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
FosbP13346 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
FosbP13346 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC31.51■■■□□ 2.63
FosbP13346 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
FosbP13346 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
FosbP13346 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
FosbP13346 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
FosbP13346 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
FosbP13346 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
FosbP13346 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
FosbP13346 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
FosbP13346 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
FosbP13346 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
FosbP13346 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC31.42■■■□□ 2.62
FosbP13346 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
FosbP13346 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
FosbP13346 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
FosbP13346 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC31.37■■■□□ 2.61
FosbP13346 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
FosbP13346 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
FosbP13346 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC31.32■■■□□ 2.6
FosbP13346 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
FosbP13346 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
FosbP13346 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
FosbP13346 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
FosbP13346 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
FosbP13346 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
FosbP13346 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC31.08■■■□□ 2.57
FosbP13346 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
FosbP13346 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
FosbP13346 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
FosbP13346 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
FosbP13346 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
FosbP13346 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
FosbP13346 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC30.94■■■□□ 2.54
FosbP13346 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
FosbP13346 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
FosbP13346 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
FosbP13346 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
FosbP13346 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
FosbP13346 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC30.81■■■□□ 2.52
FosbP13346 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
FosbP13346 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
FosbP13346 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC30.74■■■□□ 2.51
FosbP13346 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
FosbP13346 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
FosbP13346 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
FosbP13346 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC30.73■■■□□ 2.51
FosbP13346 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
FosbP13346 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
FosbP13346 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
FosbP13346 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
FosbP13346 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
FosbP13346 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
FosbP13346 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
FosbP13346 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
FosbP13346 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
FosbP13346 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
FosbP13346 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
FosbP13346 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
FosbP13346 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
FosbP13346 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
FosbP13346 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
FosbP13346 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
FosbP13346 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
FosbP13346 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
FosbP13346 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
FosbP13346 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
FosbP13346 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
FosbP13346 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
FosbP13346 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.46
FosbP13346 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
FosbP13346 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
FosbP13346 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
FosbP13346 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms