Protein–RNA interactions for Protein: P11835

Itgb2, Integrin beta-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 771 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb2P11835 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Itgb2P11835 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Itgb2P11835 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Itgb2P11835 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Itgb2P11835 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Itgb2P11835 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Itgb2P11835 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Itgb2P11835 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Itgb2P11835 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Itgb2P11835 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Itgb2P11835 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Itgb2P11835 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Itgb2P11835 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Itgb2P11835 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Itgb2P11835 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Itgb2P11835 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Itgb2P11835 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Itgb2P11835 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Itgb2P11835 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Itgb2P11835 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Itgb2P11835 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Itgb2P11835 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Itgb2P11835 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Itgb2P11835 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Itgb2P11835 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Itgb2P11835 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Itgb2P11835 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Itgb2P11835 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Itgb2P11835 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Itgb2P11835 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Itgb2P11835 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Itgb2P11835 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Itgb2P11835 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Itgb2P11835 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Itgb2P11835 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Itgb2P11835 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Itgb2P11835 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Itgb2P11835 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Itgb2P11835 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Itgb2P11835 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Itgb2P11835 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Itgb2P11835 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Itgb2P11835 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Itgb2P11835 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Itgb2P11835 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Itgb2P11835 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Itgb2P11835 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Itgb2P11835 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Itgb2P11835 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Itgb2P11835 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Itgb2P11835 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Itgb2P11835 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Itgb2P11835 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Itgb2P11835 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Itgb2P11835 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Itgb2P11835 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Itgb2P11835 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Itgb2P11835 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Itgb2P11835 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Itgb2P11835 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Itgb2P11835 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Itgb2P11835 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Itgb2P11835 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Itgb2P11835 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Itgb2P11835 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Itgb2P11835 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Itgb2P11835 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Itgb2P11835 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Itgb2P11835 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Itgb2P11835 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Itgb2P11835 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Itgb2P11835 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Itgb2P11835 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Itgb2P11835 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Itgb2P11835 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Itgb2P11835 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Itgb2P11835 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Itgb2P11835 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Itgb2P11835 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Itgb2P11835 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Itgb2P11835 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Itgb2P11835 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Itgb2P11835 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Itgb2P11835 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Itgb2P11835 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Itgb2P11835 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Itgb2P11835 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Itgb2P11835 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Itgb2P11835 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Itgb2P11835 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Itgb2P11835 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Itgb2P11835 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Itgb2P11835 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Itgb2P11835 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Itgb2P11835 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Itgb2P11835 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Itgb2P11835 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Itgb2P11835 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Itgb2P11835 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Itgb2P11835 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms