Protein–RNA interactions for Protein: P09022

Hoxa1, Homeobox protein Hox-A1, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa1P09022 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hoxa1P09022 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hoxa1P09022 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hoxa1P09022 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hoxa1P09022 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hoxa1P09022 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hoxa1P09022 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hoxa1P09022 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hoxa1P09022 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hoxa1P09022 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hoxa1P09022 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hoxa1P09022 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hoxa1P09022 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hoxa1P09022 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hoxa1P09022 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hoxa1P09022 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hoxa1P09022 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hoxa1P09022 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hoxa1P09022 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hoxa1P09022 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Hoxa1P09022 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Hoxa1P09022 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hoxa1P09022 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hoxa1P09022 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hoxa1P09022 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hoxa1P09022 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hoxa1P09022 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hoxa1P09022 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hoxa1P09022 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hoxa1P09022 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hoxa1P09022 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hoxa1P09022 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hoxa1P09022 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hoxa1P09022 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hoxa1P09022 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hoxa1P09022 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Hoxa1P09022 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hoxa1P09022 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hoxa1P09022 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hoxa1P09022 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hoxa1P09022 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hoxa1P09022 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hoxa1P09022 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hoxa1P09022 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hoxa1P09022 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hoxa1P09022 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hoxa1P09022 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hoxa1P09022 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hoxa1P09022 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hoxa1P09022 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hoxa1P09022 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hoxa1P09022 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hoxa1P09022 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hoxa1P09022 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hoxa1P09022 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hoxa1P09022 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hoxa1P09022 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hoxa1P09022 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hoxa1P09022 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hoxa1P09022 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hoxa1P09022 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hoxa1P09022 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hoxa1P09022 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hoxa1P09022 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxa1P09022 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxa1P09022 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hoxa1P09022 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hoxa1P09022 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hoxa1P09022 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxa1P09022 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hoxa1P09022 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hoxa1P09022 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Hoxa1P09022 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Hoxa1P09022 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hoxa1P09022 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxa1P09022 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hoxa1P09022 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hoxa1P09022 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hoxa1P09022 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hoxa1P09022 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hoxa1P09022 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hoxa1P09022 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hoxa1P09022 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hoxa1P09022 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hoxa1P09022 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Hoxa1P09022 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hoxa1P09022 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hoxa1P09022 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hoxa1P09022 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Hoxa1P09022 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hoxa1P09022 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hoxa1P09022 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hoxa1P09022 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hoxa1P09022 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hoxa1P09022 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hoxa1P09022 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Hoxa1P09022 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hoxa1P09022 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hoxa1P09022 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Hoxa1P09022 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms