Protein–RNA interactions for Protein: P02535

Krt10, Keratin, type I cytoskeletal 10, mousemouse

Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt10P02535 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Krt10P02535 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Krt10P02535 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Krt10P02535 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Krt10P02535 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Krt10P02535 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Krt10P02535 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Krt10P02535 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Krt10P02535 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Krt10P02535 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Krt10P02535 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Krt10P02535 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Krt10P02535 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Krt10P02535 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Krt10P02535 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Krt10P02535 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Krt10P02535 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Krt10P02535 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Krt10P02535 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Krt10P02535 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Krt10P02535 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Krt10P02535 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Krt10P02535 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Krt10P02535 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Krt10P02535 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Krt10P02535 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Krt10P02535 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Krt10P02535 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Krt10P02535 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Krt10P02535 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Krt10P02535 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Krt10P02535 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Krt10P02535 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Krt10P02535 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Krt10P02535 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Krt10P02535 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Krt10P02535 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Krt10P02535 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Krt10P02535 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Krt10P02535 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Krt10P02535 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Krt10P02535 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Krt10P02535 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Krt10P02535 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Krt10P02535 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Krt10P02535 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Krt10P02535 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Krt10P02535 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Krt10P02535 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Krt10P02535 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Krt10P02535 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Krt10P02535 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Krt10P02535 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Krt10P02535 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Krt10P02535 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Krt10P02535 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Krt10P02535 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Krt10P02535 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Krt10P02535 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Krt10P02535 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Krt10P02535 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Krt10P02535 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Krt10P02535 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Krt10P02535 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Krt10P02535 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Krt10P02535 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Krt10P02535 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Krt10P02535 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Krt10P02535 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Krt10P02535 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Krt10P02535 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Krt10P02535 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Krt10P02535 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Krt10P02535 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Krt10P02535 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Krt10P02535 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Krt10P02535 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Krt10P02535 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Krt10P02535 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Krt10P02535 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Krt10P02535 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Krt10P02535 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Krt10P02535 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Krt10P02535 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Krt10P02535 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Krt10P02535 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Krt10P02535 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Krt10P02535 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Krt10P02535 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Krt10P02535 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Krt10P02535 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Krt10P02535 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Krt10P02535 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Krt10P02535 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Krt10P02535 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Krt10P02535 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Krt10P02535 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Krt10P02535 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Krt10P02535 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Krt10P02535 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms