Protein–RNA interactions for Protein: P01904

H2-Ea, H-2 class II histocompatibility antigen, E-D alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-EaP01904 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
H2-EaP01904 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
H2-EaP01904 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
H2-EaP01904 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
H2-EaP01904 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
H2-EaP01904 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
H2-EaP01904 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
H2-EaP01904 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
H2-EaP01904 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
H2-EaP01904 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
H2-EaP01904 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
H2-EaP01904 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
H2-EaP01904 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
H2-EaP01904 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
H2-EaP01904 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
H2-EaP01904 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
H2-EaP01904 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
H2-EaP01904 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
H2-EaP01904 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
H2-EaP01904 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
H2-EaP01904 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
H2-EaP01904 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
H2-EaP01904 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
H2-EaP01904 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
H2-EaP01904 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
H2-EaP01904 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
H2-EaP01904 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
H2-EaP01904 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
H2-EaP01904 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
H2-EaP01904 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
H2-EaP01904 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
H2-EaP01904 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
H2-EaP01904 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
H2-EaP01904 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
H2-EaP01904 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
H2-EaP01904 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
H2-EaP01904 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
H2-EaP01904 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
H2-EaP01904 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
H2-EaP01904 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
H2-EaP01904 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
H2-EaP01904 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
H2-EaP01904 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
H2-EaP01904 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
H2-EaP01904 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
H2-EaP01904 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
H2-EaP01904 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
H2-EaP01904 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
H2-EaP01904 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
H2-EaP01904 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
H2-EaP01904 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
H2-EaP01904 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
H2-EaP01904 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
H2-EaP01904 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
H2-EaP01904 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
H2-EaP01904 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
H2-EaP01904 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
H2-EaP01904 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
H2-EaP01904 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
H2-EaP01904 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
H2-EaP01904 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
H2-EaP01904 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
H2-EaP01904 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
H2-EaP01904 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
H2-EaP01904 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
H2-EaP01904 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
H2-EaP01904 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
H2-EaP01904 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
H2-EaP01904 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
H2-EaP01904 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
H2-EaP01904 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
H2-EaP01904 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
H2-EaP01904 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
H2-EaP01904 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
H2-EaP01904 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
H2-EaP01904 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
H2-EaP01904 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
H2-EaP01904 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
H2-EaP01904 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
H2-EaP01904 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
H2-EaP01904 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
H2-EaP01904 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
H2-EaP01904 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
H2-EaP01904 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
H2-EaP01904 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
H2-EaP01904 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
H2-EaP01904 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
H2-EaP01904 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
H2-EaP01904 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
H2-EaP01904 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
H2-EaP01904 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
H2-EaP01904 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
H2-EaP01904 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
H2-EaP01904 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
H2-EaP01904 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
H2-EaP01904 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
H2-EaP01904 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
H2-EaP01904 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
H2-EaP01904 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
H2-EaP01904 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms