Protein–RNA interactions for Protein: P01869

Ighg1, Ig gamma-1 chain C region, membrane-bound form, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighg1P01869 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ighg1P01869 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ighg1P01869 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ighg1P01869 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ighg1P01869 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ighg1P01869 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ighg1P01869 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ighg1P01869 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ighg1P01869 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ighg1P01869 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ighg1P01869 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Ighg1P01869 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ighg1P01869 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ighg1P01869 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ighg1P01869 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ighg1P01869 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ighg1P01869 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Ighg1P01869 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ighg1P01869 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ighg1P01869 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ighg1P01869 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ighg1P01869 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ighg1P01869 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ighg1P01869 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ighg1P01869 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ighg1P01869 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ighg1P01869 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ighg1P01869 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Ighg1P01869 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ighg1P01869 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ighg1P01869 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ighg1P01869 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ighg1P01869 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ighg1P01869 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ighg1P01869 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ighg1P01869 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ighg1P01869 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ighg1P01869 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ighg1P01869 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ighg1P01869 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ighg1P01869 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ighg1P01869 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ighg1P01869 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Ighg1P01869 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ighg1P01869 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Ighg1P01869 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ighg1P01869 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ighg1P01869 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ighg1P01869 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ighg1P01869 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ighg1P01869 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ighg1P01869 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ighg1P01869 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ighg1P01869 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ighg1P01869 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ighg1P01869 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ighg1P01869 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ighg1P01869 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ighg1P01869 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ighg1P01869 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ighg1P01869 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ighg1P01869 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ighg1P01869 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ighg1P01869 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ighg1P01869 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ighg1P01869 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ighg1P01869 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ighg1P01869 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ighg1P01869 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Ighg1P01869 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ighg1P01869 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ighg1P01869 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ighg1P01869 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ighg1P01869 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ighg1P01869 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ighg1P01869 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ighg1P01869 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ighg1P01869 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ighg1P01869 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ighg1P01869 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Ighg1P01869 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ighg1P01869 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ighg1P01869 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ighg1P01869 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Ighg1P01869 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Ighg1P01869 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ighg1P01869 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ighg1P01869 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ighg1P01869 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Ighg1P01869 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ighg1P01869 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ighg1P01869 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ighg1P01869 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ighg1P01869 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ighg1P01869 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ighg1P01869 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ighg1P01869 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ighg1P01869 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ighg1P01869 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ighg1P01869 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms