Protein–RNA interactions for Protein: P01798

Ig heavy chain V-III region E109, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01798 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
P01798 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
P01798 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
P01798 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
P01798 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
P01798 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
P01798 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
P01798 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
P01798 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
P01798 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
P01798 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
P01798 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
P01798 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
P01798 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
P01798 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
P01798 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
P01798 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
P01798 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
P01798 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
P01798 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
P01798 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
P01798 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
P01798 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
P01798 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
P01798 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
P01798 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
P01798 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
P01798 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
P01798 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
P01798 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
P01798 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
P01798 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
P01798 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
P01798 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
P01798 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
P01798 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
P01798 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
P01798 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
P01798 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
P01798 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
P01798 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
P01798 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
P01798 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
P01798 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
P01798 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
P01798 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
P01798 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
P01798 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
P01798 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
P01798 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
P01798 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
P01798 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
P01798 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
P01798 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
P01798 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
P01798 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
P01798 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
P01798 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
P01798 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
P01798 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
P01798 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
P01798 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
P01798 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
P01798 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
P01798 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
P01798 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
P01798 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
P01798 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
P01798 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
P01798 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
P01798 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
P01798 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
P01798 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
P01798 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
P01798 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
P01798 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
P01798 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
P01798 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
P01798 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
P01798 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
P01798 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
P01798 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
P01798 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
P01798 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
P01798 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
P01798 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
P01798 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
P01798 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
P01798 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
P01798 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
P01798 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
P01798 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
P01798 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
P01798 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
P01798 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
P01798 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
P01798 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
P01798 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
P01798 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
P01798 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.9 ms