Protein–RNA interactions for Protein: O35646

Capn6, Calpain-6, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn6O35646 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Capn6O35646 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Capn6O35646 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Capn6O35646 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Capn6O35646 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Capn6O35646 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Capn6O35646 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Capn6O35646 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Capn6O35646 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Capn6O35646 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Capn6O35646 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Capn6O35646 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
Capn6O35646 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Capn6O35646 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Capn6O35646 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Capn6O35646 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Capn6O35646 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Capn6O35646 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.04
Capn6O35646 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Capn6O35646 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Capn6O35646 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Capn6O35646 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Capn6O35646 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Capn6O35646 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Capn6O35646 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Capn6O35646 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Capn6O35646 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Capn6O35646 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Capn6O35646 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Capn6O35646 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Capn6O35646 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
Capn6O35646 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Capn6O35646 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
Capn6O35646 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Capn6O35646 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Capn6O35646 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Capn6O35646 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Capn6O35646 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Capn6O35646 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Capn6O35646 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Capn6O35646 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Capn6O35646 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Capn6O35646 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Capn6O35646 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Capn6O35646 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Capn6O35646 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Capn6O35646 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Capn6O35646 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Capn6O35646 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Capn6O35646 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Capn6O35646 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Capn6O35646 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Capn6O35646 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Capn6O35646 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Capn6O35646 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Capn6O35646 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Capn6O35646 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Capn6O35646 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Capn6O35646 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Capn6O35646 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Capn6O35646 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Capn6O35646 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Capn6O35646 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Capn6O35646 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Capn6O35646 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Capn6O35646 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Capn6O35646 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Capn6O35646 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Capn6O35646 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Capn6O35646 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Capn6O35646 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Capn6O35646 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Capn6O35646 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Capn6O35646 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Capn6O35646 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Capn6O35646 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Capn6O35646 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Capn6O35646 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Capn6O35646 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Capn6O35646 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Capn6O35646 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Capn6O35646 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Capn6O35646 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Capn6O35646 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Capn6O35646 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Capn6O35646 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Capn6O35646 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Capn6O35646 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Capn6O35646 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Capn6O35646 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Capn6O35646 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Capn6O35646 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Capn6O35646 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Capn6O35646 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Capn6O35646 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Capn6O35646 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Capn6O35646 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Capn6O35646 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Capn6O35646 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Capn6O35646 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.6 ms