Protein–RNA interactions for Protein: O09012

Pex5, Peroxisomal targeting signal 1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pex5O09012 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Pex5O09012 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Pex5O09012 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Pex5O09012 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Pex5O09012 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Pex5O09012 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Pex5O09012 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Pex5O09012 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Pex5O09012 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Pex5O09012 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Pex5O09012 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Pex5O09012 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Pex5O09012 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Pex5O09012 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Pex5O09012 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Pex5O09012 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Pex5O09012 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Pex5O09012 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Pex5O09012 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Pex5O09012 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Pex5O09012 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Pex5O09012 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Pex5O09012 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Pex5O09012 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Pex5O09012 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Pex5O09012 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Pex5O09012 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Pex5O09012 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Pex5O09012 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Pex5O09012 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Pex5O09012 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Pex5O09012 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Pex5O09012 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Pex5O09012 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Pex5O09012 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Pex5O09012 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Pex5O09012 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Pex5O09012 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Pex5O09012 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Pex5O09012 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Pex5O09012 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Pex5O09012 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Pex5O09012 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Pex5O09012 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Pex5O09012 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Pex5O09012 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Pex5O09012 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Pex5O09012 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Pex5O09012 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Pex5O09012 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Pex5O09012 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Pex5O09012 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Pex5O09012 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Pex5O09012 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Pex5O09012 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Pex5O09012 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Pex5O09012 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Pex5O09012 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Pex5O09012 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Pex5O09012 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Pex5O09012 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Pex5O09012 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Pex5O09012 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Pex5O09012 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Pex5O09012 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Pex5O09012 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Pex5O09012 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Pex5O09012 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Pex5O09012 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Pex5O09012 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Pex5O09012 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Pex5O09012 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Pex5O09012 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Pex5O09012 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Pex5O09012 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Pex5O09012 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Pex5O09012 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Pex5O09012 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Pex5O09012 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Pex5O09012 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Pex5O09012 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Pex5O09012 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Pex5O09012 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Pex5O09012 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Pex5O09012 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Pex5O09012 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Pex5O09012 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Pex5O09012 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Pex5O09012 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Pex5O09012 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Pex5O09012 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Pex5O09012 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Pex5O09012 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Pex5O09012 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Pex5O09012 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Pex5O09012 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Pex5O09012 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Pex5O09012 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Pex5O09012 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Pex5O09012 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.6 ms