Protein–RNA interactions for Protein: L7N2F1

Vmn1r31, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r31L7N2F1 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Vmn1r31L7N2F1 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Vmn1r31L7N2F1 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Vmn1r31L7N2F1 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Vmn1r31L7N2F1 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Vmn1r31L7N2F1 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Vmn1r31L7N2F1 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Vmn1r31L7N2F1 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Vmn1r31L7N2F1 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Vmn1r31L7N2F1 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Vmn1r31L7N2F1 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Vmn1r31L7N2F1 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Vmn1r31L7N2F1 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Vmn1r31L7N2F1 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Vmn1r31L7N2F1 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Vmn1r31L7N2F1 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Vmn1r31L7N2F1 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Vmn1r31L7N2F1 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Vmn1r31L7N2F1 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Vmn1r31L7N2F1 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Vmn1r31L7N2F1 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Vmn1r31L7N2F1 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Vmn1r31L7N2F1 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Vmn1r31L7N2F1 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Vmn1r31L7N2F1 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Vmn1r31L7N2F1 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Vmn1r31L7N2F1 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Vmn1r31L7N2F1 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Vmn1r31L7N2F1 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Vmn1r31L7N2F1 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Vmn1r31L7N2F1 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Vmn1r31L7N2F1 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Vmn1r31L7N2F1 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Vmn1r31L7N2F1 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Vmn1r31L7N2F1 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Vmn1r31L7N2F1 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Vmn1r31L7N2F1 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Vmn1r31L7N2F1 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Vmn1r31L7N2F1 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Vmn1r31L7N2F1 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Vmn1r31L7N2F1 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Vmn1r31L7N2F1 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Vmn1r31L7N2F1 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Vmn1r31L7N2F1 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Vmn1r31L7N2F1 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Vmn1r31L7N2F1 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Vmn1r31L7N2F1 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Vmn1r31L7N2F1 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Vmn1r31L7N2F1 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Vmn1r31L7N2F1 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Vmn1r31L7N2F1 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Vmn1r31L7N2F1 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Vmn1r31L7N2F1 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Vmn1r31L7N2F1 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Vmn1r31L7N2F1 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Vmn1r31L7N2F1 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Vmn1r31L7N2F1 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Vmn1r31L7N2F1 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Vmn1r31L7N2F1 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Vmn1r31L7N2F1 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Vmn1r31L7N2F1 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Vmn1r31L7N2F1 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Vmn1r31L7N2F1 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Vmn1r31L7N2F1 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Vmn1r31L7N2F1 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Vmn1r31L7N2F1 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Vmn1r31L7N2F1 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Vmn1r31L7N2F1 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Vmn1r31L7N2F1 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Vmn1r31L7N2F1 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Vmn1r31L7N2F1 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Vmn1r31L7N2F1 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Vmn1r31L7N2F1 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Vmn1r31L7N2F1 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Vmn1r31L7N2F1 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Vmn1r31L7N2F1 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Vmn1r31L7N2F1 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Vmn1r31L7N2F1 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Vmn1r31L7N2F1 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Vmn1r31L7N2F1 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Vmn1r31L7N2F1 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Vmn1r31L7N2F1 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Vmn1r31L7N2F1 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Vmn1r31L7N2F1 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Vmn1r31L7N2F1 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Vmn1r31L7N2F1 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Vmn1r31L7N2F1 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Vmn1r31L7N2F1 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Vmn1r31L7N2F1 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Vmn1r31L7N2F1 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Vmn1r31L7N2F1 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Vmn1r31L7N2F1 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Vmn1r31L7N2F1 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Vmn1r31L7N2F1 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Vmn1r31L7N2F1 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Vmn1r31L7N2F1 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Vmn1r31L7N2F1 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Vmn1r31L7N2F1 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Vmn1r31L7N2F1 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Vmn1r31L7N2F1 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84 ms