Protein–RNA interactions for Protein: G3UW88

Gm44, MCG65130, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm44G3UW88 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gm44G3UW88 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Gm44G3UW88 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gm44G3UW88 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gm44G3UW88 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Gm44G3UW88 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gm44G3UW88 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gm44G3UW88 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gm44G3UW88 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gm44G3UW88 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gm44G3UW88 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gm44G3UW88 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gm44G3UW88 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Gm44G3UW88 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gm44G3UW88 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gm44G3UW88 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gm44G3UW88 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gm44G3UW88 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gm44G3UW88 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gm44G3UW88 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gm44G3UW88 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gm44G3UW88 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gm44G3UW88 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gm44G3UW88 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gm44G3UW88 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gm44G3UW88 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gm44G3UW88 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gm44G3UW88 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gm44G3UW88 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gm44G3UW88 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gm44G3UW88 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gm44G3UW88 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gm44G3UW88 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gm44G3UW88 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gm44G3UW88 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gm44G3UW88 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gm44G3UW88 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gm44G3UW88 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gm44G3UW88 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Gm44G3UW88 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gm44G3UW88 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gm44G3UW88 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gm44G3UW88 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gm44G3UW88 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gm44G3UW88 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gm44G3UW88 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gm44G3UW88 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gm44G3UW88 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gm44G3UW88 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gm44G3UW88 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Gm44G3UW88 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gm44G3UW88 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gm44G3UW88 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
Gm44G3UW88 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gm44G3UW88 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gm44G3UW88 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gm44G3UW88 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gm44G3UW88 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gm44G3UW88 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gm44G3UW88 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gm44G3UW88 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gm44G3UW88 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gm44G3UW88 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gm44G3UW88 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gm44G3UW88 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gm44G3UW88 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gm44G3UW88 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gm44G3UW88 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gm44G3UW88 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gm44G3UW88 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Gm44G3UW88 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gm44G3UW88 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gm44G3UW88 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gm44G3UW88 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gm44G3UW88 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm44G3UW88 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm44G3UW88 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm44G3UW88 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm44G3UW88 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm44G3UW88 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm44G3UW88 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm44G3UW88 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm44G3UW88 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm44G3UW88 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm44G3UW88 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm44G3UW88 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm44G3UW88 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm44G3UW88 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm44G3UW88 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Gm44G3UW88 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm44G3UW88 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm44G3UW88 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm44G3UW88 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm44G3UW88 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm44G3UW88 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm44G3UW88 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm44G3UW88 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm44G3UW88 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm44G3UW88 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm44G3UW88 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms