Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ63

Vmn1r76, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r76F8VQ63 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Vmn1r76F8VQ63 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Vmn1r76F8VQ63 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Vmn1r76F8VQ63 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Vmn1r76F8VQ63 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Vmn1r76F8VQ63 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Vmn1r76F8VQ63 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Vmn1r76F8VQ63 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Vmn1r76F8VQ63 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Vmn1r76F8VQ63 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Vmn1r76F8VQ63 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Vmn1r76F8VQ63 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Vmn1r76F8VQ63 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Vmn1r76F8VQ63 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Vmn1r76F8VQ63 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Vmn1r76F8VQ63 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Vmn1r76F8VQ63 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Vmn1r76F8VQ63 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Vmn1r76F8VQ63 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Vmn1r76F8VQ63 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Vmn1r76F8VQ63 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Vmn1r76F8VQ63 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Vmn1r76F8VQ63 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Vmn1r76F8VQ63 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Vmn1r76F8VQ63 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Vmn1r76F8VQ63 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Vmn1r76F8VQ63 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Vmn1r76F8VQ63 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Vmn1r76F8VQ63 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Vmn1r76F8VQ63 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Vmn1r76F8VQ63 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Vmn1r76F8VQ63 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Vmn1r76F8VQ63 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Vmn1r76F8VQ63 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Vmn1r76F8VQ63 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Vmn1r76F8VQ63 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Vmn1r76F8VQ63 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Vmn1r76F8VQ63 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Vmn1r76F8VQ63 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Vmn1r76F8VQ63 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Vmn1r76F8VQ63 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Vmn1r76F8VQ63 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Vmn1r76F8VQ63 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Vmn1r76F8VQ63 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Vmn1r76F8VQ63 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Vmn1r76F8VQ63 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Vmn1r76F8VQ63 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Vmn1r76F8VQ63 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Vmn1r76F8VQ63 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Vmn1r76F8VQ63 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Vmn1r76F8VQ63 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Vmn1r76F8VQ63 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Vmn1r76F8VQ63 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Vmn1r76F8VQ63 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Vmn1r76F8VQ63 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Vmn1r76F8VQ63 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Vmn1r76F8VQ63 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Vmn1r76F8VQ63 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Vmn1r76F8VQ63 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Vmn1r76F8VQ63 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Vmn1r76F8VQ63 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Vmn1r76F8VQ63 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Vmn1r76F8VQ63 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Vmn1r76F8VQ63 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Vmn1r76F8VQ63 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Vmn1r76F8VQ63 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Vmn1r76F8VQ63 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Vmn1r76F8VQ63 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Vmn1r76F8VQ63 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Vmn1r76F8VQ63 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Vmn1r76F8VQ63 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Vmn1r76F8VQ63 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Vmn1r76F8VQ63 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Vmn1r76F8VQ63 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Vmn1r76F8VQ63 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Vmn1r76F8VQ63 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Vmn1r76F8VQ63 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Vmn1r76F8VQ63 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Vmn1r76F8VQ63 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Vmn1r76F8VQ63 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Vmn1r76F8VQ63 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Vmn1r76F8VQ63 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Vmn1r76F8VQ63 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Vmn1r76F8VQ63 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Vmn1r76F8VQ63 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Vmn1r76F8VQ63 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Vmn1r76F8VQ63 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Vmn1r76F8VQ63 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Vmn1r76F8VQ63 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Vmn1r76F8VQ63 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Vmn1r76F8VQ63 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Vmn1r76F8VQ63 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Vmn1r76F8VQ63 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Vmn1r76F8VQ63 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Vmn1r76F8VQ63 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Vmn1r76F8VQ63 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Vmn1r76F8VQ63 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Vmn1r76F8VQ63 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Vmn1r76F8VQ63 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Vmn1r76F8VQ63 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms