Protein–RNA interactions for Protein: E9PV24

Fga, Fibrinogen alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 789 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgaE9PV24 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
FgaE9PV24 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
FgaE9PV24 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
FgaE9PV24 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
FgaE9PV24 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
FgaE9PV24 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
FgaE9PV24 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
FgaE9PV24 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
FgaE9PV24 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
FgaE9PV24 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
FgaE9PV24 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
FgaE9PV24 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
FgaE9PV24 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
FgaE9PV24 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
FgaE9PV24 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FgaE9PV24 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
FgaE9PV24 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
FgaE9PV24 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
FgaE9PV24 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
FgaE9PV24 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
FgaE9PV24 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
FgaE9PV24 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
FgaE9PV24 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
FgaE9PV24 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
FgaE9PV24 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
FgaE9PV24 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
FgaE9PV24 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
FgaE9PV24 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
FgaE9PV24 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
FgaE9PV24 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FgaE9PV24 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FgaE9PV24 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FgaE9PV24 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FgaE9PV24 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FgaE9PV24 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
FgaE9PV24 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FgaE9PV24 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FgaE9PV24 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
FgaE9PV24 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FgaE9PV24 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FgaE9PV24 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FgaE9PV24 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
FgaE9PV24 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FgaE9PV24 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
FgaE9PV24 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
FgaE9PV24 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
FgaE9PV24 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC26■■□□□ 1.75
FgaE9PV24 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FgaE9PV24 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
FgaE9PV24 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FgaE9PV24 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FgaE9PV24 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
FgaE9PV24 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
FgaE9PV24 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
FgaE9PV24 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
FgaE9PV24 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
FgaE9PV24 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
FgaE9PV24 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FgaE9PV24 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FgaE9PV24 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FgaE9PV24 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FgaE9PV24 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FgaE9PV24 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FgaE9PV24 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
FgaE9PV24 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FgaE9PV24 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
FgaE9PV24 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FgaE9PV24 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FgaE9PV24 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
FgaE9PV24 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FgaE9PV24 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FgaE9PV24 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FgaE9PV24 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
FgaE9PV24 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FgaE9PV24 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
FgaE9PV24 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FgaE9PV24 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FgaE9PV24 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
FgaE9PV24 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FgaE9PV24 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FgaE9PV24 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
FgaE9PV24 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
FgaE9PV24 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FgaE9PV24 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FgaE9PV24 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
FgaE9PV24 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FgaE9PV24 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
FgaE9PV24 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FgaE9PV24 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FgaE9PV24 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FgaE9PV24 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FgaE9PV24 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FgaE9PV24 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FgaE9PV24 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FgaE9PV24 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FgaE9PV24 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
FgaE9PV24 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
FgaE9PV24 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
FgaE9PV24 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FgaE9PV24 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.9 ms