Protein–RNA interactions for Protein: D3YUH6

Ube2d4, Ubiquitin-conjugating enzyme E2D 4, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d4D3YUH6 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ube2d4D3YUH6 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ube2d4D3YUH6 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ube2d4D3YUH6 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ube2d4D3YUH6 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ube2d4D3YUH6 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ube2d4D3YUH6 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ube2d4D3YUH6 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ube2d4D3YUH6 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ube2d4D3YUH6 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ube2d4D3YUH6 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ube2d4D3YUH6 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ube2d4D3YUH6 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ube2d4D3YUH6 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ube2d4D3YUH6 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ube2d4D3YUH6 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ube2d4D3YUH6 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ube2d4D3YUH6 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ube2d4D3YUH6 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ube2d4D3YUH6 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ube2d4D3YUH6 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ube2d4D3YUH6 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ube2d4D3YUH6 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ube2d4D3YUH6 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ube2d4D3YUH6 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ube2d4D3YUH6 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ube2d4D3YUH6 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Ube2d4D3YUH6 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ube2d4D3YUH6 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ube2d4D3YUH6 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ube2d4D3YUH6 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ube2d4D3YUH6 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ube2d4D3YUH6 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ube2d4D3YUH6 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ube2d4D3YUH6 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ube2d4D3YUH6 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ube2d4D3YUH6 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ube2d4D3YUH6 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ube2d4D3YUH6 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ube2d4D3YUH6 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ube2d4D3YUH6 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ube2d4D3YUH6 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ube2d4D3YUH6 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ube2d4D3YUH6 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ube2d4D3YUH6 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ube2d4D3YUH6 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ube2d4D3YUH6 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ube2d4D3YUH6 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ube2d4D3YUH6 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Ube2d4D3YUH6 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ube2d4D3YUH6 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ube2d4D3YUH6 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ube2d4D3YUH6 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ube2d4D3YUH6 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ube2d4D3YUH6 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ube2d4D3YUH6 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ube2d4D3YUH6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ube2d4D3YUH6 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ube2d4D3YUH6 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ube2d4D3YUH6 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ube2d4D3YUH6 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ube2d4D3YUH6 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ube2d4D3YUH6 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ube2d4D3YUH6 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ube2d4D3YUH6 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ube2d4D3YUH6 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ube2d4D3YUH6 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ube2d4D3YUH6 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Ube2d4D3YUH6 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Ube2d4D3YUH6 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ube2d4D3YUH6 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ube2d4D3YUH6 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ube2d4D3YUH6 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ube2d4D3YUH6 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ube2d4D3YUH6 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ube2d4D3YUH6 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ube2d4D3YUH6 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ube2d4D3YUH6 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ube2d4D3YUH6 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ube2d4D3YUH6 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ube2d4D3YUH6 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ube2d4D3YUH6 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ube2d4D3YUH6 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ube2d4D3YUH6 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ube2d4D3YUH6 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ube2d4D3YUH6 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ube2d4D3YUH6 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ube2d4D3YUH6 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ube2d4D3YUH6 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ube2d4D3YUH6 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ube2d4D3YUH6 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ube2d4D3YUH6 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ube2d4D3YUH6 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ube2d4D3YUH6 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ube2d4D3YUH6 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ube2d4D3YUH6 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ube2d4D3YUH6 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ube2d4D3YUH6 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ube2d4D3YUH6 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ube2d4D3YUH6 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms