Protein–RNA interactions for Protein: A2A870

Fbf1, Fas-binding factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbf1A2A870 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Fbf1A2A870 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Fbf1A2A870 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Fbf1A2A870 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Fbf1A2A870 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Fbf1A2A870 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Fbf1A2A870 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Fbf1A2A870 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Fbf1A2A870 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Fbf1A2A870 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Fbf1A2A870 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Fbf1A2A870 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Fbf1A2A870 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Fbf1A2A870 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Fbf1A2A870 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Fbf1A2A870 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Fbf1A2A870 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Fbf1A2A870 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Fbf1A2A870 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Fbf1A2A870 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Fbf1A2A870 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Fbf1A2A870 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Fbf1A2A870 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Fbf1A2A870 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Fbf1A2A870 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Fbf1A2A870 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Fbf1A2A870 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Fbf1A2A870 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Fbf1A2A870 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Fbf1A2A870 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Fbf1A2A870 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Fbf1A2A870 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Fbf1A2A870 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Fbf1A2A870 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Fbf1A2A870 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Fbf1A2A870 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Fbf1A2A870 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Fbf1A2A870 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Fbf1A2A870 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Fbf1A2A870 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Fbf1A2A870 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Fbf1A2A870 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Fbf1A2A870 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Fbf1A2A870 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Fbf1A2A870 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Fbf1A2A870 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Fbf1A2A870 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Fbf1A2A870 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Fbf1A2A870 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Fbf1A2A870 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Fbf1A2A870 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Fbf1A2A870 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Fbf1A2A870 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Fbf1A2A870 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Fbf1A2A870 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Fbf1A2A870 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Fbf1A2A870 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Fbf1A2A870 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Fbf1A2A870 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Fbf1A2A870 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Fbf1A2A870 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Fbf1A2A870 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Fbf1A2A870 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Fbf1A2A870 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Fbf1A2A870 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Fbf1A2A870 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Fbf1A2A870 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Fbf1A2A870 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Fbf1A2A870 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Fbf1A2A870 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Fbf1A2A870 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Fbf1A2A870 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Fbf1A2A870 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Fbf1A2A870 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Fbf1A2A870 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Fbf1A2A870 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Fbf1A2A870 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Fbf1A2A870 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Fbf1A2A870 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Fbf1A2A870 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Fbf1A2A870 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Fbf1A2A870 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Fbf1A2A870 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Fbf1A2A870 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Fbf1A2A870 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Fbf1A2A870 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Fbf1A2A870 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Fbf1A2A870 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Fbf1A2A870 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Fbf1A2A870 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Fbf1A2A870 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Fbf1A2A870 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Fbf1A2A870 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Fbf1A2A870 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Fbf1A2A870 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Fbf1A2A870 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Fbf1A2A870 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Fbf1A2A870 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Fbf1A2A870 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Fbf1A2A870 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms