Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2M6

Ubl3, Ubiquitin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl3Q9Z2M6 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ubl3Q9Z2M6 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ubl3Q9Z2M6 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ubl3Q9Z2M6 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ubl3Q9Z2M6 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ubl3Q9Z2M6 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ubl3Q9Z2M6 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ubl3Q9Z2M6 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ubl3Q9Z2M6 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ubl3Q9Z2M6 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ubl3Q9Z2M6 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ubl3Q9Z2M6 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ubl3Q9Z2M6 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ubl3Q9Z2M6 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ubl3Q9Z2M6 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ubl3Q9Z2M6 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ubl3Q9Z2M6 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ubl3Q9Z2M6 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ubl3Q9Z2M6 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ubl3Q9Z2M6 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ubl3Q9Z2M6 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ubl3Q9Z2M6 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ubl3Q9Z2M6 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ubl3Q9Z2M6 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ubl3Q9Z2M6 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ubl3Q9Z2M6 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ubl3Q9Z2M6 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ubl3Q9Z2M6 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ubl3Q9Z2M6 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ubl3Q9Z2M6 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ubl3Q9Z2M6 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ubl3Q9Z2M6 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ubl3Q9Z2M6 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ubl3Q9Z2M6 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ubl3Q9Z2M6 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Ubl3Q9Z2M6 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ubl3Q9Z2M6 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ubl3Q9Z2M6 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ubl3Q9Z2M6 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ubl3Q9Z2M6 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ubl3Q9Z2M6 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ubl3Q9Z2M6 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ubl3Q9Z2M6 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ubl3Q9Z2M6 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ubl3Q9Z2M6 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ubl3Q9Z2M6 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
Ubl3Q9Z2M6 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ubl3Q9Z2M6 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ubl3Q9Z2M6 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ubl3Q9Z2M6 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ubl3Q9Z2M6 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ubl3Q9Z2M6 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ubl3Q9Z2M6 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ubl3Q9Z2M6 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ubl3Q9Z2M6 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ubl3Q9Z2M6 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ubl3Q9Z2M6 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ubl3Q9Z2M6 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ubl3Q9Z2M6 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ubl3Q9Z2M6 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ubl3Q9Z2M6 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ubl3Q9Z2M6 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ubl3Q9Z2M6 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ubl3Q9Z2M6 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ubl3Q9Z2M6 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ubl3Q9Z2M6 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ubl3Q9Z2M6 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ubl3Q9Z2M6 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ubl3Q9Z2M6 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ubl3Q9Z2M6 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ubl3Q9Z2M6 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ubl3Q9Z2M6 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ubl3Q9Z2M6 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ubl3Q9Z2M6 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ubl3Q9Z2M6 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ubl3Q9Z2M6 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ubl3Q9Z2M6 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ubl3Q9Z2M6 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ubl3Q9Z2M6 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ubl3Q9Z2M6 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ubl3Q9Z2M6 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ubl3Q9Z2M6 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ubl3Q9Z2M6 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ubl3Q9Z2M6 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ubl3Q9Z2M6 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ubl3Q9Z2M6 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ubl3Q9Z2M6 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ubl3Q9Z2M6 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ubl3Q9Z2M6 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ubl3Q9Z2M6 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ubl3Q9Z2M6 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ubl3Q9Z2M6 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ubl3Q9Z2M6 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ubl3Q9Z2M6 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ubl3Q9Z2M6 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ubl3Q9Z2M6 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ubl3Q9Z2M6 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ubl3Q9Z2M6 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ubl3Q9Z2M6 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ubl3Q9Z2M6 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms