Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2C4

Mtmr1, Myotubularin-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtmr1Q9Z2C4 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mtmr1Q9Z2C4 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mtmr1Q9Z2C4 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mtmr1Q9Z2C4 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Mtmr1Q9Z2C4 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mtmr1Q9Z2C4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mtmr1Q9Z2C4 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mtmr1Q9Z2C4 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mtmr1Q9Z2C4 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mtmr1Q9Z2C4 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mtmr1Q9Z2C4 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Mtmr1Q9Z2C4 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Mtmr1Q9Z2C4 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mtmr1Q9Z2C4 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mtmr1Q9Z2C4 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mtmr1Q9Z2C4 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mtmr1Q9Z2C4 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mtmr1Q9Z2C4 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mtmr1Q9Z2C4 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Mtmr1Q9Z2C4 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Mtmr1Q9Z2C4 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Mtmr1Q9Z2C4 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Mtmr1Q9Z2C4 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mtmr1Q9Z2C4 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mtmr1Q9Z2C4 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mtmr1Q9Z2C4 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mtmr1Q9Z2C4 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mtmr1Q9Z2C4 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mtmr1Q9Z2C4 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mtmr1Q9Z2C4 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mtmr1Q9Z2C4 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mtmr1Q9Z2C4 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mtmr1Q9Z2C4 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mtmr1Q9Z2C4 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mtmr1Q9Z2C4 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mtmr1Q9Z2C4 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Mtmr1Q9Z2C4 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mtmr1Q9Z2C4 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mtmr1Q9Z2C4 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Mtmr1Q9Z2C4 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mtmr1Q9Z2C4 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mtmr1Q9Z2C4 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mtmr1Q9Z2C4 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mtmr1Q9Z2C4 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mtmr1Q9Z2C4 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Mtmr1Q9Z2C4 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mtmr1Q9Z2C4 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mtmr1Q9Z2C4 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mtmr1Q9Z2C4 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mtmr1Q9Z2C4 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mtmr1Q9Z2C4 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mtmr1Q9Z2C4 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Mtmr1Q9Z2C4 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Mtmr1Q9Z2C4 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Mtmr1Q9Z2C4 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Mtmr1Q9Z2C4 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Mtmr1Q9Z2C4 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mtmr1Q9Z2C4 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mtmr1Q9Z2C4 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mtmr1Q9Z2C4 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mtmr1Q9Z2C4 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mtmr1Q9Z2C4 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mtmr1Q9Z2C4 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mtmr1Q9Z2C4 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mtmr1Q9Z2C4 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mtmr1Q9Z2C4 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Mtmr1Q9Z2C4 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Mtmr1Q9Z2C4 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mtmr1Q9Z2C4 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mtmr1Q9Z2C4 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mtmr1Q9Z2C4 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mtmr1Q9Z2C4 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mtmr1Q9Z2C4 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mtmr1Q9Z2C4 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mtmr1Q9Z2C4 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mtmr1Q9Z2C4 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mtmr1Q9Z2C4 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mtmr1Q9Z2C4 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mtmr1Q9Z2C4 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mtmr1Q9Z2C4 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mtmr1Q9Z2C4 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mtmr1Q9Z2C4 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mtmr1Q9Z2C4 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mtmr1Q9Z2C4 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mtmr1Q9Z2C4 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mtmr1Q9Z2C4 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Mtmr1Q9Z2C4 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Mtmr1Q9Z2C4 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Mtmr1Q9Z2C4 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Mtmr1Q9Z2C4 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Mtmr1Q9Z2C4 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Mtmr1Q9Z2C4 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Mtmr1Q9Z2C4 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Mtmr1Q9Z2C4 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Mtmr1Q9Z2C4 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Mtmr1Q9Z2C4 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Mtmr1Q9Z2C4 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Mtmr1Q9Z2C4 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mtmr1Q9Z2C4 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mtmr1Q9Z2C4 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.1 ms