Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z273

Tulp1, Tubby-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tulp1Q9Z273 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tulp1Q9Z273 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tulp1Q9Z273 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tulp1Q9Z273 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Tulp1Q9Z273 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tulp1Q9Z273 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tulp1Q9Z273 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tulp1Q9Z273 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Tulp1Q9Z273 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tulp1Q9Z273 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tulp1Q9Z273 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tulp1Q9Z273 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tulp1Q9Z273 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tulp1Q9Z273 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tulp1Q9Z273 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tulp1Q9Z273 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tulp1Q9Z273 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tulp1Q9Z273 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tulp1Q9Z273 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Tulp1Q9Z273 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tulp1Q9Z273 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tulp1Q9Z273 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tulp1Q9Z273 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tulp1Q9Z273 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tulp1Q9Z273 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tulp1Q9Z273 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tulp1Q9Z273 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tulp1Q9Z273 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tulp1Q9Z273 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tulp1Q9Z273 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tulp1Q9Z273 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tulp1Q9Z273 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tulp1Q9Z273 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tulp1Q9Z273 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tulp1Q9Z273 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tulp1Q9Z273 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tulp1Q9Z273 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tulp1Q9Z273 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tulp1Q9Z273 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tulp1Q9Z273 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tulp1Q9Z273 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tulp1Q9Z273 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tulp1Q9Z273 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tulp1Q9Z273 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tulp1Q9Z273 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tulp1Q9Z273 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tulp1Q9Z273 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tulp1Q9Z273 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tulp1Q9Z273 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tulp1Q9Z273 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tulp1Q9Z273 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tulp1Q9Z273 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tulp1Q9Z273 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tulp1Q9Z273 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tulp1Q9Z273 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tulp1Q9Z273 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tulp1Q9Z273 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tulp1Q9Z273 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tulp1Q9Z273 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tulp1Q9Z273 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tulp1Q9Z273 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tulp1Q9Z273 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tulp1Q9Z273 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tulp1Q9Z273 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tulp1Q9Z273 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tulp1Q9Z273 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tulp1Q9Z273 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tulp1Q9Z273 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tulp1Q9Z273 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tulp1Q9Z273 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tulp1Q9Z273 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tulp1Q9Z273 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tulp1Q9Z273 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Tulp1Q9Z273 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tulp1Q9Z273 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tulp1Q9Z273 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tulp1Q9Z273 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tulp1Q9Z273 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Tulp1Q9Z273 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tulp1Q9Z273 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tulp1Q9Z273 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tulp1Q9Z273 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tulp1Q9Z273 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tulp1Q9Z273 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tulp1Q9Z273 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tulp1Q9Z273 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tulp1Q9Z273 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tulp1Q9Z273 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tulp1Q9Z273 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tulp1Q9Z273 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tulp1Q9Z273 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tulp1Q9Z273 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tulp1Q9Z273 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tulp1Q9Z273 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tulp1Q9Z273 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tulp1Q9Z273 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tulp1Q9Z273 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tulp1Q9Z273 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tulp1Q9Z273 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tulp1Q9Z273 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms