Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV35

Apobec2, C->U-editing enzyme APOBEC-2, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec2Q9WV35 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Apobec2Q9WV35 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Apobec2Q9WV35 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Apobec2Q9WV35 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Apobec2Q9WV35 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Apobec2Q9WV35 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Apobec2Q9WV35 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Apobec2Q9WV35 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Apobec2Q9WV35 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Apobec2Q9WV35 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Apobec2Q9WV35 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Apobec2Q9WV35 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Apobec2Q9WV35 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Apobec2Q9WV35 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Apobec2Q9WV35 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Apobec2Q9WV35 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Apobec2Q9WV35 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Apobec2Q9WV35 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Apobec2Q9WV35 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Apobec2Q9WV35 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Apobec2Q9WV35 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Apobec2Q9WV35 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Apobec2Q9WV35 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Apobec2Q9WV35 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Apobec2Q9WV35 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Apobec2Q9WV35 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Apobec2Q9WV35 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Apobec2Q9WV35 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Apobec2Q9WV35 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Apobec2Q9WV35 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Apobec2Q9WV35 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Apobec2Q9WV35 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Apobec2Q9WV35 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Apobec2Q9WV35 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Apobec2Q9WV35 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Apobec2Q9WV35 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Apobec2Q9WV35 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Apobec2Q9WV35 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Apobec2Q9WV35 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Apobec2Q9WV35 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Apobec2Q9WV35 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Apobec2Q9WV35 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Apobec2Q9WV35 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Apobec2Q9WV35 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Apobec2Q9WV35 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Apobec2Q9WV35 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Apobec2Q9WV35 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Apobec2Q9WV35 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Apobec2Q9WV35 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Apobec2Q9WV35 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Apobec2Q9WV35 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Apobec2Q9WV35 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Apobec2Q9WV35 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Apobec2Q9WV35 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Apobec2Q9WV35 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Apobec2Q9WV35 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Apobec2Q9WV35 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Apobec2Q9WV35 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Apobec2Q9WV35 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Apobec2Q9WV35 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Apobec2Q9WV35 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Apobec2Q9WV35 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Apobec2Q9WV35 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Apobec2Q9WV35 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Apobec2Q9WV35 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Apobec2Q9WV35 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Apobec2Q9WV35 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Apobec2Q9WV35 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Apobec2Q9WV35 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Apobec2Q9WV35 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Apobec2Q9WV35 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Apobec2Q9WV35 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Apobec2Q9WV35 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Apobec2Q9WV35 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Apobec2Q9WV35 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Apobec2Q9WV35 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Apobec2Q9WV35 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Apobec2Q9WV35 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Apobec2Q9WV35 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Apobec2Q9WV35 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Apobec2Q9WV35 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Apobec2Q9WV35 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Apobec2Q9WV35 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Apobec2Q9WV35 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Apobec2Q9WV35 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Apobec2Q9WV35 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Apobec2Q9WV35 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Apobec2Q9WV35 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Apobec2Q9WV35 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Apobec2Q9WV35 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Apobec2Q9WV35 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Apobec2Q9WV35 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Apobec2Q9WV35 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Apobec2Q9WV35 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Apobec2Q9WV35 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Apobec2Q9WV35 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Apobec2Q9WV35 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Apobec2Q9WV35 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Apobec2Q9WV35 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Apobec2Q9WV35 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms