Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUF1

Vmn1r49, Vomeronasal type-1 receptor 49, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r49Q9WUF1 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vmn1r49Q9WUF1 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Vmn1r49Q9WUF1 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vmn1r49Q9WUF1 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vmn1r49Q9WUF1 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vmn1r49Q9WUF1 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Vmn1r49Q9WUF1 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vmn1r49Q9WUF1 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vmn1r49Q9WUF1 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vmn1r49Q9WUF1 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Vmn1r49Q9WUF1 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vmn1r49Q9WUF1 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Vmn1r49Q9WUF1 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vmn1r49Q9WUF1 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vmn1r49Q9WUF1 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Vmn1r49Q9WUF1 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vmn1r49Q9WUF1 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Vmn1r49Q9WUF1 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vmn1r49Q9WUF1 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vmn1r49Q9WUF1 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vmn1r49Q9WUF1 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vmn1r49Q9WUF1 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vmn1r49Q9WUF1 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Vmn1r49Q9WUF1 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vmn1r49Q9WUF1 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vmn1r49Q9WUF1 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Vmn1r49Q9WUF1 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vmn1r49Q9WUF1 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Vmn1r49Q9WUF1 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Vmn1r49Q9WUF1 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Vmn1r49Q9WUF1 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vmn1r49Q9WUF1 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Vmn1r49Q9WUF1 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Vmn1r49Q9WUF1 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Vmn1r49Q9WUF1 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vmn1r49Q9WUF1 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vmn1r49Q9WUF1 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vmn1r49Q9WUF1 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vmn1r49Q9WUF1 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vmn1r49Q9WUF1 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vmn1r49Q9WUF1 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vmn1r49Q9WUF1 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Vmn1r49Q9WUF1 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vmn1r49Q9WUF1 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vmn1r49Q9WUF1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vmn1r49Q9WUF1 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vmn1r49Q9WUF1 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vmn1r49Q9WUF1 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
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Vmn1r49Q9WUF1 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
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Vmn1r49Q9WUF1 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vmn1r49Q9WUF1 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vmn1r49Q9WUF1 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vmn1r49Q9WUF1 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vmn1r49Q9WUF1 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
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Vmn1r49Q9WUF1 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vmn1r49Q9WUF1 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vmn1r49Q9WUF1 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vmn1r49Q9WUF1 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vmn1r49Q9WUF1 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vmn1r49Q9WUF1 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vmn1r49Q9WUF1 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
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Vmn1r49Q9WUF1 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
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Vmn1r49Q9WUF1 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vmn1r49Q9WUF1 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vmn1r49Q9WUF1 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vmn1r49Q9WUF1 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Vmn1r49Q9WUF1 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vmn1r49Q9WUF1 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vmn1r49Q9WUF1 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vmn1r49Q9WUF1 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vmn1r49Q9WUF1 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vmn1r49Q9WUF1 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vmn1r49Q9WUF1 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vmn1r49Q9WUF1 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vmn1r49Q9WUF1 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vmn1r49Q9WUF1 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vmn1r49Q9WUF1 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vmn1r49Q9WUF1 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vmn1r49Q9WUF1 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vmn1r49Q9WUF1 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vmn1r49Q9WUF1 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vmn1r49Q9WUF1 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vmn1r49Q9WUF1 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vmn1r49Q9WUF1 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vmn1r49Q9WUF1 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vmn1r49Q9WUF1 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vmn1r49Q9WUF1 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vmn1r49Q9WUF1 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vmn1r49Q9WUF1 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
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Vmn1r49Q9WUF1 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
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