Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0Y8

Gabrg1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit gamma-1, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabrg1Q9R0Y8 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gabrg1Q9R0Y8 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gabrg1Q9R0Y8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gabrg1Q9R0Y8 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Gabrg1Q9R0Y8 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gabrg1Q9R0Y8 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gabrg1Q9R0Y8 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gabrg1Q9R0Y8 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gabrg1Q9R0Y8 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gabrg1Q9R0Y8 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gabrg1Q9R0Y8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gabrg1Q9R0Y8 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gabrg1Q9R0Y8 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gabrg1Q9R0Y8 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Gabrg1Q9R0Y8 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gabrg1Q9R0Y8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gabrg1Q9R0Y8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gabrg1Q9R0Y8 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
Gabrg1Q9R0Y8 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gabrg1Q9R0Y8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gabrg1Q9R0Y8 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gabrg1Q9R0Y8 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gabrg1Q9R0Y8 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Gabrg1Q9R0Y8 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gabrg1Q9R0Y8 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gabrg1Q9R0Y8 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gabrg1Q9R0Y8 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gabrg1Q9R0Y8 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gabrg1Q9R0Y8 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gabrg1Q9R0Y8 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gabrg1Q9R0Y8 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gabrg1Q9R0Y8 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gabrg1Q9R0Y8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gabrg1Q9R0Y8 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gabrg1Q9R0Y8 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gabrg1Q9R0Y8 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gabrg1Q9R0Y8 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gabrg1Q9R0Y8 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gabrg1Q9R0Y8 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gabrg1Q9R0Y8 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Gabrg1Q9R0Y8 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gabrg1Q9R0Y8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gabrg1Q9R0Y8 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gabrg1Q9R0Y8 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gabrg1Q9R0Y8 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gabrg1Q9R0Y8 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gabrg1Q9R0Y8 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gabrg1Q9R0Y8 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gabrg1Q9R0Y8 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gabrg1Q9R0Y8 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gabrg1Q9R0Y8 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gabrg1Q9R0Y8 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gabrg1Q9R0Y8 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gabrg1Q9R0Y8 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gabrg1Q9R0Y8 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gabrg1Q9R0Y8 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gabrg1Q9R0Y8 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gabrg1Q9R0Y8 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Gabrg1Q9R0Y8 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gabrg1Q9R0Y8 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gabrg1Q9R0Y8 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Gabrg1Q9R0Y8 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gabrg1Q9R0Y8 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gabrg1Q9R0Y8 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gabrg1Q9R0Y8 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gabrg1Q9R0Y8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gabrg1Q9R0Y8 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gabrg1Q9R0Y8 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Gabrg1Q9R0Y8 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gabrg1Q9R0Y8 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gabrg1Q9R0Y8 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gabrg1Q9R0Y8 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gabrg1Q9R0Y8 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gabrg1Q9R0Y8 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Gabrg1Q9R0Y8 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gabrg1Q9R0Y8 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gabrg1Q9R0Y8 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gabrg1Q9R0Y8 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gabrg1Q9R0Y8 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gabrg1Q9R0Y8 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gabrg1Q9R0Y8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gabrg1Q9R0Y8 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gabrg1Q9R0Y8 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gabrg1Q9R0Y8 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gabrg1Q9R0Y8 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gabrg1Q9R0Y8 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gabrg1Q9R0Y8 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gabrg1Q9R0Y8 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gabrg1Q9R0Y8 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gabrg1Q9R0Y8 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gabrg1Q9R0Y8 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gabrg1Q9R0Y8 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gabrg1Q9R0Y8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gabrg1Q9R0Y8 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gabrg1Q9R0Y8 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gabrg1Q9R0Y8 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gabrg1Q9R0Y8 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gabrg1Q9R0Y8 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Gabrg1Q9R0Y8 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gabrg1Q9R0Y8 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms