Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0G8

Nrk, Nik-related protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrkQ9R0G8 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
NrkQ9R0G8 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
NrkQ9R0G8 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
NrkQ9R0G8 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC34.86■■■■□ 3.17
NrkQ9R0G8 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
NrkQ9R0G8 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC34.85■■■■□ 3.17
NrkQ9R0G8 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
NrkQ9R0G8 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
NrkQ9R0G8 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
NrkQ9R0G8 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC34.85■■■■□ 3.17
NrkQ9R0G8 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
NrkQ9R0G8 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
NrkQ9R0G8 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC34.84■■■■□ 3.17
NrkQ9R0G8 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC34.84■■■■□ 3.17
NrkQ9R0G8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
NrkQ9R0G8 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
NrkQ9R0G8 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
NrkQ9R0G8 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
NrkQ9R0G8 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
NrkQ9R0G8 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
NrkQ9R0G8 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.16
NrkQ9R0G8 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.16
NrkQ9R0G8 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
NrkQ9R0G8 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
NrkQ9R0G8 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
NrkQ9R0G8 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
NrkQ9R0G8 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC34.81■■■■□ 3.16
NrkQ9R0G8 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
NrkQ9R0G8 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
NrkQ9R0G8 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
NrkQ9R0G8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC34.79■■■■□ 3.16
NrkQ9R0G8 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
NrkQ9R0G8 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
NrkQ9R0G8 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC34.78■■■■□ 3.16
NrkQ9R0G8 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
NrkQ9R0G8 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
NrkQ9R0G8 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
NrkQ9R0G8 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
NrkQ9R0G8 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
NrkQ9R0G8 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
NrkQ9R0G8 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
NrkQ9R0G8 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC34.76■■■■□ 3.15
NrkQ9R0G8 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
NrkQ9R0G8 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
NrkQ9R0G8 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
NrkQ9R0G8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
NrkQ9R0G8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
NrkQ9R0G8 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
NrkQ9R0G8 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
NrkQ9R0G8 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
NrkQ9R0G8 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
NrkQ9R0G8 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
NrkQ9R0G8 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC34.72■■■■□ 3.15
NrkQ9R0G8 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
NrkQ9R0G8 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
NrkQ9R0G8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
NrkQ9R0G8 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
NrkQ9R0G8 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
NrkQ9R0G8 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
NrkQ9R0G8 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
NrkQ9R0G8 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
NrkQ9R0G8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
NrkQ9R0G8 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC34.7■■■■□ 3.15
NrkQ9R0G8 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
NrkQ9R0G8 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC34.7■■■■□ 3.15
NrkQ9R0G8 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
NrkQ9R0G8 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
NrkQ9R0G8 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
NrkQ9R0G8 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
NrkQ9R0G8 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
NrkQ9R0G8 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
NrkQ9R0G8 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.69■■■■□ 3.14
NrkQ9R0G8 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC34.69■■■■□ 3.14
NrkQ9R0G8 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC34.68■■■■□ 3.14
NrkQ9R0G8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
NrkQ9R0G8 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
NrkQ9R0G8 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
NrkQ9R0G8 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
NrkQ9R0G8 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
NrkQ9R0G8 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC34.67■■■■□ 3.14
NrkQ9R0G8 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
NrkQ9R0G8 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC34.67■■■■□ 3.14
NrkQ9R0G8 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
NrkQ9R0G8 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
NrkQ9R0G8 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
NrkQ9R0G8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
NrkQ9R0G8 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
NrkQ9R0G8 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
NrkQ9R0G8 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
NrkQ9R0G8 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
NrkQ9R0G8 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
NrkQ9R0G8 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
NrkQ9R0G8 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
NrkQ9R0G8 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
NrkQ9R0G8 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
NrkQ9R0G8 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
NrkQ9R0G8 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
NrkQ9R0G8 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
NrkQ9R0G8 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
NrkQ9R0G8 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 182.3 ms