Protein–RNA interactions for Protein: Q9R088

Tk2, Thymidine kinase 2, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tk2Q9R088 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tk2Q9R088 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tk2Q9R088 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tk2Q9R088 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tk2Q9R088 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tk2Q9R088 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tk2Q9R088 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tk2Q9R088 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tk2Q9R088 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tk2Q9R088 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tk2Q9R088 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tk2Q9R088 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tk2Q9R088 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tk2Q9R088 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tk2Q9R088 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Tk2Q9R088 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tk2Q9R088 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tk2Q9R088 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tk2Q9R088 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tk2Q9R088 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Tk2Q9R088 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tk2Q9R088 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tk2Q9R088 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tk2Q9R088 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tk2Q9R088 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tk2Q9R088 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tk2Q9R088 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tk2Q9R088 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tk2Q9R088 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tk2Q9R088 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tk2Q9R088 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tk2Q9R088 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tk2Q9R088 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tk2Q9R088 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tk2Q9R088 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tk2Q9R088 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Tk2Q9R088 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tk2Q9R088 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tk2Q9R088 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tk2Q9R088 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Tk2Q9R088 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tk2Q9R088 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tk2Q9R088 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tk2Q9R088 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tk2Q9R088 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tk2Q9R088 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tk2Q9R088 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tk2Q9R088 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tk2Q9R088 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tk2Q9R088 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tk2Q9R088 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tk2Q9R088 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tk2Q9R088 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Tk2Q9R088 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Tk2Q9R088 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tk2Q9R088 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tk2Q9R088 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tk2Q9R088 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tk2Q9R088 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tk2Q9R088 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Tk2Q9R088 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tk2Q9R088 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tk2Q9R088 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tk2Q9R088 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tk2Q9R088 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tk2Q9R088 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tk2Q9R088 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tk2Q9R088 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tk2Q9R088 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tk2Q9R088 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tk2Q9R088 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tk2Q9R088 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tk2Q9R088 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tk2Q9R088 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tk2Q9R088 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tk2Q9R088 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tk2Q9R088 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tk2Q9R088 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tk2Q9R088 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tk2Q9R088 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Tk2Q9R088 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tk2Q9R088 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tk2Q9R088 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tk2Q9R088 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tk2Q9R088 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tk2Q9R088 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tk2Q9R088 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tk2Q9R088 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tk2Q9R088 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tk2Q9R088 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tk2Q9R088 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tk2Q9R088 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tk2Q9R088 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tk2Q9R088 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tk2Q9R088 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tk2Q9R088 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tk2Q9R088 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tk2Q9R088 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tk2Q9R088 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tk2Q9R088 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.5 ms