Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ49

Ubxn8, UBX domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn8Q9QZ49 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ubxn8Q9QZ49 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ubxn8Q9QZ49 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ubxn8Q9QZ49 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ubxn8Q9QZ49 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ubxn8Q9QZ49 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ubxn8Q9QZ49 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ubxn8Q9QZ49 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ubxn8Q9QZ49 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ubxn8Q9QZ49 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ubxn8Q9QZ49 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ubxn8Q9QZ49 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ubxn8Q9QZ49 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ubxn8Q9QZ49 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ubxn8Q9QZ49 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ubxn8Q9QZ49 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ubxn8Q9QZ49 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ubxn8Q9QZ49 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Ubxn8Q9QZ49 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ubxn8Q9QZ49 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ubxn8Q9QZ49 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ubxn8Q9QZ49 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ubxn8Q9QZ49 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ubxn8Q9QZ49 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ubxn8Q9QZ49 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ubxn8Q9QZ49 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ubxn8Q9QZ49 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ubxn8Q9QZ49 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ubxn8Q9QZ49 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ubxn8Q9QZ49 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Ubxn8Q9QZ49 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ubxn8Q9QZ49 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ubxn8Q9QZ49 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ubxn8Q9QZ49 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ubxn8Q9QZ49 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ubxn8Q9QZ49 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ubxn8Q9QZ49 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Ubxn8Q9QZ49 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ubxn8Q9QZ49 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ubxn8Q9QZ49 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ubxn8Q9QZ49 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ubxn8Q9QZ49 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ubxn8Q9QZ49 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ubxn8Q9QZ49 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Ubxn8Q9QZ49 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ubxn8Q9QZ49 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ubxn8Q9QZ49 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Ubxn8Q9QZ49 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ubxn8Q9QZ49 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ubxn8Q9QZ49 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ubxn8Q9QZ49 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ubxn8Q9QZ49 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ubxn8Q9QZ49 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ubxn8Q9QZ49 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ubxn8Q9QZ49 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ubxn8Q9QZ49 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ubxn8Q9QZ49 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ubxn8Q9QZ49 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ubxn8Q9QZ49 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ubxn8Q9QZ49 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ubxn8Q9QZ49 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ubxn8Q9QZ49 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Ubxn8Q9QZ49 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ubxn8Q9QZ49 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Ubxn8Q9QZ49 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ubxn8Q9QZ49 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ubxn8Q9QZ49 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ubxn8Q9QZ49 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ubxn8Q9QZ49 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ubxn8Q9QZ49 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ubxn8Q9QZ49 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ubxn8Q9QZ49 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ubxn8Q9QZ49 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ubxn8Q9QZ49 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ubxn8Q9QZ49 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ubxn8Q9QZ49 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Ubxn8Q9QZ49 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ubxn8Q9QZ49 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ubxn8Q9QZ49 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ubxn8Q9QZ49 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ubxn8Q9QZ49 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ubxn8Q9QZ49 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ubxn8Q9QZ49 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Ubxn8Q9QZ49 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ubxn8Q9QZ49 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ubxn8Q9QZ49 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ubxn8Q9QZ49 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ubxn8Q9QZ49 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ubxn8Q9QZ49 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ubxn8Q9QZ49 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ubxn8Q9QZ49 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ubxn8Q9QZ49 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ubxn8Q9QZ49 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ubxn8Q9QZ49 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ubxn8Q9QZ49 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ubxn8Q9QZ49 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ubxn8Q9QZ49 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ubxn8Q9QZ49 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ubxn8Q9QZ49 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ubxn8Q9QZ49 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.8 ms