Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY40

Plxnb3, Plexin-B3, mousemouse

Predictions only

Length 1,902 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plxnb3Q9QY40 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Plxnb3Q9QY40 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Plxnb3Q9QY40 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Plxnb3Q9QY40 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Plxnb3Q9QY40 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Plxnb3Q9QY40 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Plxnb3Q9QY40 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Plxnb3Q9QY40 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Plxnb3Q9QY40 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Plxnb3Q9QY40 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Plxnb3Q9QY40 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Plxnb3Q9QY40 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Plxnb3Q9QY40 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Plxnb3Q9QY40 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Plxnb3Q9QY40 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Plxnb3Q9QY40 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Plxnb3Q9QY40 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Plxnb3Q9QY40 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Plxnb3Q9QY40 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Plxnb3Q9QY40 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Plxnb3Q9QY40 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Plxnb3Q9QY40 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Plxnb3Q9QY40 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Plxnb3Q9QY40 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Plxnb3Q9QY40 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Plxnb3Q9QY40 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Plxnb3Q9QY40 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Plxnb3Q9QY40 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Plxnb3Q9QY40 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Plxnb3Q9QY40 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Plxnb3Q9QY40 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Plxnb3Q9QY40 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Plxnb3Q9QY40 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Plxnb3Q9QY40 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Plxnb3Q9QY40 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Plxnb3Q9QY40 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Plxnb3Q9QY40 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Plxnb3Q9QY40 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Plxnb3Q9QY40 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Plxnb3Q9QY40 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Plxnb3Q9QY40 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Plxnb3Q9QY40 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Plxnb3Q9QY40 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Plxnb3Q9QY40 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Plxnb3Q9QY40 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Plxnb3Q9QY40 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Plxnb3Q9QY40 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Plxnb3Q9QY40 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Plxnb3Q9QY40 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Plxnb3Q9QY40 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Plxnb3Q9QY40 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Plxnb3Q9QY40 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Plxnb3Q9QY40 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Plxnb3Q9QY40 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Plxnb3Q9QY40 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Plxnb3Q9QY40 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Plxnb3Q9QY40 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Plxnb3Q9QY40 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Plxnb3Q9QY40 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Plxnb3Q9QY40 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Plxnb3Q9QY40 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Plxnb3Q9QY40 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Plxnb3Q9QY40 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Plxnb3Q9QY40 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Plxnb3Q9QY40 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Plxnb3Q9QY40 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Plxnb3Q9QY40 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Plxnb3Q9QY40 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Plxnb3Q9QY40 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Plxnb3Q9QY40 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Plxnb3Q9QY40 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Plxnb3Q9QY40 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Plxnb3Q9QY40 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Plxnb3Q9QY40 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Plxnb3Q9QY40 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Plxnb3Q9QY40 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Plxnb3Q9QY40 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Plxnb3Q9QY40 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Plxnb3Q9QY40 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Plxnb3Q9QY40 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Plxnb3Q9QY40 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Plxnb3Q9QY40 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Plxnb3Q9QY40 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Plxnb3Q9QY40 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Plxnb3Q9QY40 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Plxnb3Q9QY40 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Plxnb3Q9QY40 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Plxnb3Q9QY40 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Plxnb3Q9QY40 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Plxnb3Q9QY40 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Plxnb3Q9QY40 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Plxnb3Q9QY40 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Plxnb3Q9QY40 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Plxnb3Q9QY40 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Plxnb3Q9QY40 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Plxnb3Q9QY40 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Plxnb3Q9QY40 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Plxnb3Q9QY40 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Plxnb3Q9QY40 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Plxnb3Q9QY40 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63 ms