Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX11

Cyth1, Cytohesin-1, mousemouse

Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyth1Q9QX11 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cyth1Q9QX11 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cyth1Q9QX11 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cyth1Q9QX11 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cyth1Q9QX11 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cyth1Q9QX11 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cyth1Q9QX11 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cyth1Q9QX11 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cyth1Q9QX11 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cyth1Q9QX11 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cyth1Q9QX11 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cyth1Q9QX11 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cyth1Q9QX11 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cyth1Q9QX11 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cyth1Q9QX11 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Cyth1Q9QX11 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cyth1Q9QX11 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cyth1Q9QX11 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cyth1Q9QX11 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cyth1Q9QX11 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cyth1Q9QX11 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cyth1Q9QX11 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cyth1Q9QX11 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cyth1Q9QX11 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cyth1Q9QX11 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cyth1Q9QX11 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cyth1Q9QX11 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cyth1Q9QX11 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cyth1Q9QX11 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cyth1Q9QX11 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cyth1Q9QX11 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cyth1Q9QX11 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cyth1Q9QX11 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cyth1Q9QX11 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cyth1Q9QX11 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cyth1Q9QX11 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cyth1Q9QX11 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cyth1Q9QX11 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cyth1Q9QX11 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cyth1Q9QX11 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cyth1Q9QX11 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cyth1Q9QX11 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cyth1Q9QX11 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cyth1Q9QX11 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cyth1Q9QX11 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Cyth1Q9QX11 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cyth1Q9QX11 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cyth1Q9QX11 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cyth1Q9QX11 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cyth1Q9QX11 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cyth1Q9QX11 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cyth1Q9QX11 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cyth1Q9QX11 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cyth1Q9QX11 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cyth1Q9QX11 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cyth1Q9QX11 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cyth1Q9QX11 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cyth1Q9QX11 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cyth1Q9QX11 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Cyth1Q9QX11 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cyth1Q9QX11 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cyth1Q9QX11 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cyth1Q9QX11 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cyth1Q9QX11 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cyth1Q9QX11 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cyth1Q9QX11 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cyth1Q9QX11 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cyth1Q9QX11 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cyth1Q9QX11 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cyth1Q9QX11 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cyth1Q9QX11 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cyth1Q9QX11 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cyth1Q9QX11 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cyth1Q9QX11 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cyth1Q9QX11 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cyth1Q9QX11 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cyth1Q9QX11 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cyth1Q9QX11 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cyth1Q9QX11 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cyth1Q9QX11 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cyth1Q9QX11 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cyth1Q9QX11 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cyth1Q9QX11 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cyth1Q9QX11 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cyth1Q9QX11 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cyth1Q9QX11 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cyth1Q9QX11 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cyth1Q9QX11 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cyth1Q9QX11 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cyth1Q9QX11 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cyth1Q9QX11 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cyth1Q9QX11 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cyth1Q9QX11 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cyth1Q9QX11 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cyth1Q9QX11 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cyth1Q9QX11 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cyth1Q9QX11 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cyth1Q9QX11 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cyth1Q9QX11 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cyth1Q9QX11 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms