Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMH6

Txnrd1, Thioredoxin reductase 1, cytoplasmic, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Txnrd1Q9JMH6 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Txnrd1Q9JMH6 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Txnrd1Q9JMH6 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Txnrd1Q9JMH6 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Txnrd1Q9JMH6 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Txnrd1Q9JMH6 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Txnrd1Q9JMH6 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Txnrd1Q9JMH6 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Txnrd1Q9JMH6 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Txnrd1Q9JMH6 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Txnrd1Q9JMH6 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Txnrd1Q9JMH6 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Txnrd1Q9JMH6 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Txnrd1Q9JMH6 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Txnrd1Q9JMH6 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Txnrd1Q9JMH6 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Txnrd1Q9JMH6 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Txnrd1Q9JMH6 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Txnrd1Q9JMH6 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Txnrd1Q9JMH6 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Txnrd1Q9JMH6 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Txnrd1Q9JMH6 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Txnrd1Q9JMH6 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Txnrd1Q9JMH6 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Txnrd1Q9JMH6 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Txnrd1Q9JMH6 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Txnrd1Q9JMH6 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Txnrd1Q9JMH6 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Txnrd1Q9JMH6 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Txnrd1Q9JMH6 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Txnrd1Q9JMH6 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Txnrd1Q9JMH6 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Txnrd1Q9JMH6 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Txnrd1Q9JMH6 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Txnrd1Q9JMH6 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Txnrd1Q9JMH6 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Txnrd1Q9JMH6 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Txnrd1Q9JMH6 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Txnrd1Q9JMH6 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Txnrd1Q9JMH6 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Txnrd1Q9JMH6 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Txnrd1Q9JMH6 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Txnrd1Q9JMH6 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Txnrd1Q9JMH6 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Txnrd1Q9JMH6 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Txnrd1Q9JMH6 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Txnrd1Q9JMH6 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Txnrd1Q9JMH6 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Txnrd1Q9JMH6 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Txnrd1Q9JMH6 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Txnrd1Q9JMH6 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Txnrd1Q9JMH6 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Txnrd1Q9JMH6 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Txnrd1Q9JMH6 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Txnrd1Q9JMH6 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Txnrd1Q9JMH6 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Txnrd1Q9JMH6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Txnrd1Q9JMH6 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Txnrd1Q9JMH6 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Txnrd1Q9JMH6 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Txnrd1Q9JMH6 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Txnrd1Q9JMH6 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Txnrd1Q9JMH6 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Txnrd1Q9JMH6 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Txnrd1Q9JMH6 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Txnrd1Q9JMH6 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Txnrd1Q9JMH6 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Txnrd1Q9JMH6 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Txnrd1Q9JMH6 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Txnrd1Q9JMH6 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Txnrd1Q9JMH6 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Txnrd1Q9JMH6 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Txnrd1Q9JMH6 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Txnrd1Q9JMH6 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Txnrd1Q9JMH6 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Txnrd1Q9JMH6 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Txnrd1Q9JMH6 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Txnrd1Q9JMH6 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Txnrd1Q9JMH6 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Txnrd1Q9JMH6 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Txnrd1Q9JMH6 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Txnrd1Q9JMH6 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Txnrd1Q9JMH6 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Txnrd1Q9JMH6 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Txnrd1Q9JMH6 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Txnrd1Q9JMH6 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Txnrd1Q9JMH6 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Txnrd1Q9JMH6 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Txnrd1Q9JMH6 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Txnrd1Q9JMH6 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Txnrd1Q9JMH6 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Txnrd1Q9JMH6 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Txnrd1Q9JMH6 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Txnrd1Q9JMH6 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Txnrd1Q9JMH6 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Txnrd1Q9JMH6 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Txnrd1Q9JMH6 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Txnrd1Q9JMH6 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Txnrd1Q9JMH6 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Txnrd1Q9JMH6 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms