Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLV6

Pnkp, Bifunctional polynucleotide phosphatase/kinase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PnkpQ9JLV6 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PnkpQ9JLV6 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PnkpQ9JLV6 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PnkpQ9JLV6 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PnkpQ9JLV6 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PnkpQ9JLV6 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PnkpQ9JLV6 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PnkpQ9JLV6 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PnkpQ9JLV6 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PnkpQ9JLV6 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PnkpQ9JLV6 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PnkpQ9JLV6 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PnkpQ9JLV6 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PnkpQ9JLV6 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PnkpQ9JLV6 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PnkpQ9JLV6 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PnkpQ9JLV6 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PnkpQ9JLV6 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PnkpQ9JLV6 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PnkpQ9JLV6 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PnkpQ9JLV6 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PnkpQ9JLV6 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PnkpQ9JLV6 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PnkpQ9JLV6 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PnkpQ9JLV6 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PnkpQ9JLV6 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PnkpQ9JLV6 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PnkpQ9JLV6 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PnkpQ9JLV6 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PnkpQ9JLV6 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PnkpQ9JLV6 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PnkpQ9JLV6 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PnkpQ9JLV6 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PnkpQ9JLV6 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PnkpQ9JLV6 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PnkpQ9JLV6 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PnkpQ9JLV6 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PnkpQ9JLV6 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PnkpQ9JLV6 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PnkpQ9JLV6 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PnkpQ9JLV6 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PnkpQ9JLV6 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PnkpQ9JLV6 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PnkpQ9JLV6 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PnkpQ9JLV6 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PnkpQ9JLV6 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PnkpQ9JLV6 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PnkpQ9JLV6 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PnkpQ9JLV6 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PnkpQ9JLV6 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PnkpQ9JLV6 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PnkpQ9JLV6 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PnkpQ9JLV6 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PnkpQ9JLV6 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PnkpQ9JLV6 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PnkpQ9JLV6 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PnkpQ9JLV6 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PnkpQ9JLV6 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PnkpQ9JLV6 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PnkpQ9JLV6 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PnkpQ9JLV6 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PnkpQ9JLV6 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PnkpQ9JLV6 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PnkpQ9JLV6 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PnkpQ9JLV6 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PnkpQ9JLV6 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PnkpQ9JLV6 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PnkpQ9JLV6 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PnkpQ9JLV6 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PnkpQ9JLV6 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PnkpQ9JLV6 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PnkpQ9JLV6 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PnkpQ9JLV6 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PnkpQ9JLV6 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PnkpQ9JLV6 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PnkpQ9JLV6 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PnkpQ9JLV6 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PnkpQ9JLV6 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PnkpQ9JLV6 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PnkpQ9JLV6 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PnkpQ9JLV6 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PnkpQ9JLV6 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PnkpQ9JLV6 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PnkpQ9JLV6 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PnkpQ9JLV6 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PnkpQ9JLV6 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PnkpQ9JLV6 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PnkpQ9JLV6 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PnkpQ9JLV6 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PnkpQ9JLV6 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PnkpQ9JLV6 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PnkpQ9JLV6 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PnkpQ9JLV6 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PnkpQ9JLV6 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PnkpQ9JLV6 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PnkpQ9JLV6 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PnkpQ9JLV6 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PnkpQ9JLV6 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PnkpQ9JLV6 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PnkpQ9JLV6 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms