Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKX4

Aatf, Protein AATF, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 526 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AatfQ9JKX4 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AatfQ9JKX4 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AatfQ9JKX4 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AatfQ9JKX4 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AatfQ9JKX4 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AatfQ9JKX4 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
AatfQ9JKX4 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AatfQ9JKX4 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
AatfQ9JKX4 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AatfQ9JKX4 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
AatfQ9JKX4 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
AatfQ9JKX4 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AatfQ9JKX4 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AatfQ9JKX4 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AatfQ9JKX4 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
AatfQ9JKX4 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
AatfQ9JKX4 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
AatfQ9JKX4 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
AatfQ9JKX4 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
AatfQ9JKX4 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
AatfQ9JKX4 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
AatfQ9JKX4 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
AatfQ9JKX4 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AatfQ9JKX4 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
AatfQ9JKX4 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AatfQ9JKX4 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AatfQ9JKX4 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AatfQ9JKX4 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AatfQ9JKX4 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AatfQ9JKX4 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AatfQ9JKX4 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AatfQ9JKX4 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AatfQ9JKX4 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
AatfQ9JKX4 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
AatfQ9JKX4 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
AatfQ9JKX4 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
AatfQ9JKX4 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
AatfQ9JKX4 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
AatfQ9JKX4 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
AatfQ9JKX4 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
AatfQ9JKX4 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
AatfQ9JKX4 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AatfQ9JKX4 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AatfQ9JKX4 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AatfQ9JKX4 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AatfQ9JKX4 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AatfQ9JKX4 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AatfQ9JKX4 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
AatfQ9JKX4 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
AatfQ9JKX4 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
AatfQ9JKX4 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
AatfQ9JKX4 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AatfQ9JKX4 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AatfQ9JKX4 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AatfQ9JKX4 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AatfQ9JKX4 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AatfQ9JKX4 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
AatfQ9JKX4 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
AatfQ9JKX4 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AatfQ9JKX4 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
AatfQ9JKX4 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AatfQ9JKX4 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
AatfQ9JKX4 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AatfQ9JKX4 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AatfQ9JKX4 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AatfQ9JKX4 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
AatfQ9JKX4 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
AatfQ9JKX4 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AatfQ9JKX4 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
AatfQ9JKX4 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AatfQ9JKX4 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AatfQ9JKX4 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
AatfQ9JKX4 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
AatfQ9JKX4 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
AatfQ9JKX4 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
AatfQ9JKX4 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
AatfQ9JKX4 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
AatfQ9JKX4 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
AatfQ9JKX4 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
AatfQ9JKX4 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
AatfQ9JKX4 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AatfQ9JKX4 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AatfQ9JKX4 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AatfQ9JKX4 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AatfQ9JKX4 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AatfQ9JKX4 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AatfQ9JKX4 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AatfQ9JKX4 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AatfQ9JKX4 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AatfQ9JKX4 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
AatfQ9JKX4 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
AatfQ9JKX4 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
AatfQ9JKX4 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
AatfQ9JKX4 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
AatfQ9JKX4 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
AatfQ9JKX4 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
AatfQ9JKX4 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
AatfQ9JKX4 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
AatfQ9JKX4 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
AatfQ9JKX4 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms