Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJS0

Scube2, Signal peptide, CUB and EGF-like domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scube2Q9JJS0 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Scube2Q9JJS0 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Scube2Q9JJS0 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Scube2Q9JJS0 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Scube2Q9JJS0 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Scube2Q9JJS0 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Scube2Q9JJS0 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Scube2Q9JJS0 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Scube2Q9JJS0 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Scube2Q9JJS0 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Scube2Q9JJS0 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Scube2Q9JJS0 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Scube2Q9JJS0 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Scube2Q9JJS0 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Scube2Q9JJS0 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Scube2Q9JJS0 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Scube2Q9JJS0 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Scube2Q9JJS0 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Scube2Q9JJS0 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Scube2Q9JJS0 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Scube2Q9JJS0 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Scube2Q9JJS0 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Scube2Q9JJS0 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Scube2Q9JJS0 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Scube2Q9JJS0 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Scube2Q9JJS0 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Scube2Q9JJS0 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Scube2Q9JJS0 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Scube2Q9JJS0 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Scube2Q9JJS0 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Scube2Q9JJS0 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Scube2Q9JJS0 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Scube2Q9JJS0 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Scube2Q9JJS0 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Scube2Q9JJS0 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Scube2Q9JJS0 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Scube2Q9JJS0 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Scube2Q9JJS0 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Scube2Q9JJS0 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Scube2Q9JJS0 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Scube2Q9JJS0 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Scube2Q9JJS0 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Scube2Q9JJS0 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Scube2Q9JJS0 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Scube2Q9JJS0 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Scube2Q9JJS0 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Scube2Q9JJS0 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Scube2Q9JJS0 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Scube2Q9JJS0 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Scube2Q9JJS0 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Scube2Q9JJS0 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Scube2Q9JJS0 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Scube2Q9JJS0 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Scube2Q9JJS0 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Scube2Q9JJS0 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Scube2Q9JJS0 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Scube2Q9JJS0 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Scube2Q9JJS0 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Scube2Q9JJS0 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Scube2Q9JJS0 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Scube2Q9JJS0 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Scube2Q9JJS0 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Scube2Q9JJS0 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Scube2Q9JJS0 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Scube2Q9JJS0 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Scube2Q9JJS0 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Scube2Q9JJS0 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Scube2Q9JJS0 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Scube2Q9JJS0 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Scube2Q9JJS0 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Scube2Q9JJS0 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Scube2Q9JJS0 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Scube2Q9JJS0 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Scube2Q9JJS0 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Scube2Q9JJS0 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Scube2Q9JJS0 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Scube2Q9JJS0 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Scube2Q9JJS0 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Scube2Q9JJS0 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Scube2Q9JJS0 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Scube2Q9JJS0 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Scube2Q9JJS0 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Scube2Q9JJS0 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Scube2Q9JJS0 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Scube2Q9JJS0 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Scube2Q9JJS0 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Scube2Q9JJS0 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Scube2Q9JJS0 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Scube2Q9JJS0 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Scube2Q9JJS0 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Scube2Q9JJS0 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Scube2Q9JJS0 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Scube2Q9JJS0 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Scube2Q9JJS0 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Scube2Q9JJS0 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Scube2Q9JJS0 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Scube2Q9JJS0 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Scube2Q9JJS0 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Scube2Q9JJS0 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Scube2Q9JJS0 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
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