Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ80

Rpf2, Ribosome production factor 2 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpf2Q9JJ80 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rpf2Q9JJ80 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rpf2Q9JJ80 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rpf2Q9JJ80 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rpf2Q9JJ80 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rpf2Q9JJ80 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Rpf2Q9JJ80 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rpf2Q9JJ80 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rpf2Q9JJ80 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rpf2Q9JJ80 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rpf2Q9JJ80 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rpf2Q9JJ80 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rpf2Q9JJ80 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rpf2Q9JJ80 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rpf2Q9JJ80 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rpf2Q9JJ80 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rpf2Q9JJ80 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rpf2Q9JJ80 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rpf2Q9JJ80 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rpf2Q9JJ80 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rpf2Q9JJ80 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rpf2Q9JJ80 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rpf2Q9JJ80 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rpf2Q9JJ80 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rpf2Q9JJ80 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Rpf2Q9JJ80 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rpf2Q9JJ80 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rpf2Q9JJ80 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rpf2Q9JJ80 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rpf2Q9JJ80 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rpf2Q9JJ80 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rpf2Q9JJ80 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rpf2Q9JJ80 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rpf2Q9JJ80 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rpf2Q9JJ80 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rpf2Q9JJ80 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rpf2Q9JJ80 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rpf2Q9JJ80 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rpf2Q9JJ80 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rpf2Q9JJ80 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Rpf2Q9JJ80 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rpf2Q9JJ80 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rpf2Q9JJ80 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rpf2Q9JJ80 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rpf2Q9JJ80 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rpf2Q9JJ80 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rpf2Q9JJ80 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rpf2Q9JJ80 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rpf2Q9JJ80 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rpf2Q9JJ80 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rpf2Q9JJ80 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rpf2Q9JJ80 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rpf2Q9JJ80 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rpf2Q9JJ80 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rpf2Q9JJ80 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rpf2Q9JJ80 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rpf2Q9JJ80 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rpf2Q9JJ80 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Rpf2Q9JJ80 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rpf2Q9JJ80 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rpf2Q9JJ80 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rpf2Q9JJ80 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rpf2Q9JJ80 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rpf2Q9JJ80 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rpf2Q9JJ80 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rpf2Q9JJ80 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rpf2Q9JJ80 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rpf2Q9JJ80 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rpf2Q9JJ80 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rpf2Q9JJ80 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rpf2Q9JJ80 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rpf2Q9JJ80 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rpf2Q9JJ80 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rpf2Q9JJ80 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rpf2Q9JJ80 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rpf2Q9JJ80 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rpf2Q9JJ80 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rpf2Q9JJ80 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rpf2Q9JJ80 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rpf2Q9JJ80 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rpf2Q9JJ80 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rpf2Q9JJ80 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rpf2Q9JJ80 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rpf2Q9JJ80 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Rpf2Q9JJ80 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rpf2Q9JJ80 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rpf2Q9JJ80 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rpf2Q9JJ80 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rpf2Q9JJ80 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rpf2Q9JJ80 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rpf2Q9JJ80 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rpf2Q9JJ80 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rpf2Q9JJ80 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rpf2Q9JJ80 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rpf2Q9JJ80 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rpf2Q9JJ80 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rpf2Q9JJ80 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rpf2Q9JJ80 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Rpf2Q9JJ80 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rpf2Q9JJ80 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms