Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI60

Lrat, Lecithin retinol acyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LratQ9JI60 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LratQ9JI60 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LratQ9JI60 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LratQ9JI60 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LratQ9JI60 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LratQ9JI60 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LratQ9JI60 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LratQ9JI60 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LratQ9JI60 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LratQ9JI60 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LratQ9JI60 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LratQ9JI60 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LratQ9JI60 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LratQ9JI60 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LratQ9JI60 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LratQ9JI60 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
LratQ9JI60 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LratQ9JI60 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LratQ9JI60 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LratQ9JI60 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LratQ9JI60 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LratQ9JI60 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LratQ9JI60 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LratQ9JI60 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LratQ9JI60 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LratQ9JI60 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
LratQ9JI60 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LratQ9JI60 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LratQ9JI60 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LratQ9JI60 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LratQ9JI60 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LratQ9JI60 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LratQ9JI60 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LratQ9JI60 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LratQ9JI60 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LratQ9JI60 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LratQ9JI60 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LratQ9JI60 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LratQ9JI60 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LratQ9JI60 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LratQ9JI60 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LratQ9JI60 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LratQ9JI60 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LratQ9JI60 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LratQ9JI60 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
LratQ9JI60 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LratQ9JI60 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LratQ9JI60 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LratQ9JI60 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LratQ9JI60 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LratQ9JI60 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LratQ9JI60 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LratQ9JI60 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LratQ9JI60 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LratQ9JI60 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
LratQ9JI60 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LratQ9JI60 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LratQ9JI60 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LratQ9JI60 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LratQ9JI60 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LratQ9JI60 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LratQ9JI60 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LratQ9JI60 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LratQ9JI60 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LratQ9JI60 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
LratQ9JI60 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LratQ9JI60 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LratQ9JI60 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LratQ9JI60 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LratQ9JI60 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
LratQ9JI60 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC26■■□□□ 1.75
LratQ9JI60 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LratQ9JI60 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LratQ9JI60 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LratQ9JI60 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LratQ9JI60 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LratQ9JI60 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LratQ9JI60 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LratQ9JI60 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LratQ9JI60 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LratQ9JI60 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LratQ9JI60 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LratQ9JI60 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LratQ9JI60 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LratQ9JI60 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LratQ9JI60 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LratQ9JI60 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LratQ9JI60 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LratQ9JI60 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LratQ9JI60 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
LratQ9JI60 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
LratQ9JI60 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
LratQ9JI60 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LratQ9JI60 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LratQ9JI60 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LratQ9JI60 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LratQ9JI60 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LratQ9JI60 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LratQ9JI60 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LratQ9JI60 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms