Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHB3

Timp4, Metalloproteinase inhibitor 4, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timp4Q9JHB3 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Timp4Q9JHB3 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Timp4Q9JHB3 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Timp4Q9JHB3 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Timp4Q9JHB3 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Timp4Q9JHB3 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Timp4Q9JHB3 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Timp4Q9JHB3 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Timp4Q9JHB3 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Timp4Q9JHB3 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Timp4Q9JHB3 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Timp4Q9JHB3 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Timp4Q9JHB3 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Timp4Q9JHB3 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Timp4Q9JHB3 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Timp4Q9JHB3 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Timp4Q9JHB3 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Timp4Q9JHB3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Timp4Q9JHB3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Timp4Q9JHB3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Timp4Q9JHB3 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Timp4Q9JHB3 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Timp4Q9JHB3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Timp4Q9JHB3 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Timp4Q9JHB3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Timp4Q9JHB3 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Timp4Q9JHB3 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Timp4Q9JHB3 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Timp4Q9JHB3 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Timp4Q9JHB3 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Timp4Q9JHB3 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Timp4Q9JHB3 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Timp4Q9JHB3 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Timp4Q9JHB3 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Timp4Q9JHB3 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Timp4Q9JHB3 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Timp4Q9JHB3 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Timp4Q9JHB3 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Timp4Q9JHB3 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Timp4Q9JHB3 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Timp4Q9JHB3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Timp4Q9JHB3 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Timp4Q9JHB3 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Timp4Q9JHB3 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Timp4Q9JHB3 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Timp4Q9JHB3 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Timp4Q9JHB3 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Timp4Q9JHB3 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Timp4Q9JHB3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Timp4Q9JHB3 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Timp4Q9JHB3 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Timp4Q9JHB3 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Timp4Q9JHB3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Timp4Q9JHB3 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Timp4Q9JHB3 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Timp4Q9JHB3 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Timp4Q9JHB3 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Timp4Q9JHB3 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Timp4Q9JHB3 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Timp4Q9JHB3 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Timp4Q9JHB3 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Timp4Q9JHB3 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Timp4Q9JHB3 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Timp4Q9JHB3 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Timp4Q9JHB3 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Timp4Q9JHB3 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Timp4Q9JHB3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Timp4Q9JHB3 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Timp4Q9JHB3 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Timp4Q9JHB3 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Timp4Q9JHB3 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Timp4Q9JHB3 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Timp4Q9JHB3 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Timp4Q9JHB3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Timp4Q9JHB3 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Timp4Q9JHB3 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Timp4Q9JHB3 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Timp4Q9JHB3 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Timp4Q9JHB3 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Timp4Q9JHB3 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Timp4Q9JHB3 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Timp4Q9JHB3 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Timp4Q9JHB3 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Timp4Q9JHB3 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Timp4Q9JHB3 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Timp4Q9JHB3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Timp4Q9JHB3 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Timp4Q9JHB3 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Timp4Q9JHB3 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Timp4Q9JHB3 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Timp4Q9JHB3 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Timp4Q9JHB3 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Timp4Q9JHB3 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Timp4Q9JHB3 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Timp4Q9JHB3 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Timp4Q9JHB3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Timp4Q9JHB3 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Timp4Q9JHB3 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Timp4Q9JHB3 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Timp4Q9JHB3 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms