Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESX4

Zcchc17, Nucleolar protein of 40 kDa, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc17Q9ESX4 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Zcchc17Q9ESX4 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Zcchc17Q9ESX4 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Zcchc17Q9ESX4 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Zcchc17Q9ESX4 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Zcchc17Q9ESX4 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Zcchc17Q9ESX4 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Zcchc17Q9ESX4 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Zcchc17Q9ESX4 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Zcchc17Q9ESX4 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Zcchc17Q9ESX4 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Zcchc17Q9ESX4 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Zcchc17Q9ESX4 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Zcchc17Q9ESX4 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Zcchc17Q9ESX4 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Zcchc17Q9ESX4 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Zcchc17Q9ESX4 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Zcchc17Q9ESX4 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Zcchc17Q9ESX4 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Zcchc17Q9ESX4 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Zcchc17Q9ESX4 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Zcchc17Q9ESX4 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Zcchc17Q9ESX4 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Zcchc17Q9ESX4 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Zcchc17Q9ESX4 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Zcchc17Q9ESX4 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Zcchc17Q9ESX4 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Zcchc17Q9ESX4 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Zcchc17Q9ESX4 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Zcchc17Q9ESX4 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Zcchc17Q9ESX4 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Zcchc17Q9ESX4 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Zcchc17Q9ESX4 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Zcchc17Q9ESX4 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Zcchc17Q9ESX4 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Zcchc17Q9ESX4 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Zcchc17Q9ESX4 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Zcchc17Q9ESX4 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Zcchc17Q9ESX4 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Zcchc17Q9ESX4 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Zcchc17Q9ESX4 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Zcchc17Q9ESX4 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Zcchc17Q9ESX4 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Zcchc17Q9ESX4 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Zcchc17Q9ESX4 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Zcchc17Q9ESX4 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Zcchc17Q9ESX4 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Zcchc17Q9ESX4 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Zcchc17Q9ESX4 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Zcchc17Q9ESX4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Zcchc17Q9ESX4 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Zcchc17Q9ESX4 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Zcchc17Q9ESX4 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Zcchc17Q9ESX4 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Zcchc17Q9ESX4 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Zcchc17Q9ESX4 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Zcchc17Q9ESX4 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Zcchc17Q9ESX4 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Zcchc17Q9ESX4 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Zcchc17Q9ESX4 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Zcchc17Q9ESX4 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Zcchc17Q9ESX4 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Zcchc17Q9ESX4 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Zcchc17Q9ESX4 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Zcchc17Q9ESX4 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Zcchc17Q9ESX4 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Zcchc17Q9ESX4 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Zcchc17Q9ESX4 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Zcchc17Q9ESX4 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Zcchc17Q9ESX4 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Zcchc17Q9ESX4 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Zcchc17Q9ESX4 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Zcchc17Q9ESX4 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Zcchc17Q9ESX4 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Zcchc17Q9ESX4 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Zcchc17Q9ESX4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Zcchc17Q9ESX4 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Zcchc17Q9ESX4 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Zcchc17Q9ESX4 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Zcchc17Q9ESX4 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Zcchc17Q9ESX4 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Zcchc17Q9ESX4 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Zcchc17Q9ESX4 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Zcchc17Q9ESX4 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Zcchc17Q9ESX4 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Zcchc17Q9ESX4 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Zcchc17Q9ESX4 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Zcchc17Q9ESX4 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Zcchc17Q9ESX4 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Zcchc17Q9ESX4 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Zcchc17Q9ESX4 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Zcchc17Q9ESX4 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Zcchc17Q9ESX4 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Zcchc17Q9ESX4 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Zcchc17Q9ESX4 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Zcchc17Q9ESX4 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Zcchc17Q9ESX4 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Zcchc17Q9ESX4 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Zcchc17Q9ESX4 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Zcchc17Q9ESX4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
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