Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESX4

Zcchc17, Nucleolar protein of 40 kDa, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc17Q9ESX4 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Zcchc17Q9ESX4 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Zcchc17Q9ESX4 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Zcchc17Q9ESX4 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Zcchc17Q9ESX4 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Zcchc17Q9ESX4 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Zcchc17Q9ESX4 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Zcchc17Q9ESX4 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Zcchc17Q9ESX4 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Zcchc17Q9ESX4 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Zcchc17Q9ESX4 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Zcchc17Q9ESX4 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Zcchc17Q9ESX4 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Zcchc17Q9ESX4 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Zcchc17Q9ESX4 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Zcchc17Q9ESX4 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Zcchc17Q9ESX4 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Zcchc17Q9ESX4 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Zcchc17Q9ESX4 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Zcchc17Q9ESX4 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Zcchc17Q9ESX4 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Zcchc17Q9ESX4 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Zcchc17Q9ESX4 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Zcchc17Q9ESX4 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Zcchc17Q9ESX4 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Zcchc17Q9ESX4 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Zcchc17Q9ESX4 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Zcchc17Q9ESX4 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Zcchc17Q9ESX4 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Zcchc17Q9ESX4 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Zcchc17Q9ESX4 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Zcchc17Q9ESX4 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Zcchc17Q9ESX4 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Zcchc17Q9ESX4 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Zcchc17Q9ESX4 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Zcchc17Q9ESX4 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Zcchc17Q9ESX4 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Zcchc17Q9ESX4 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Zcchc17Q9ESX4 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Zcchc17Q9ESX4 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Zcchc17Q9ESX4 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Zcchc17Q9ESX4 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Zcchc17Q9ESX4 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Zcchc17Q9ESX4 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Zcchc17Q9ESX4 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Zcchc17Q9ESX4 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Zcchc17Q9ESX4 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Zcchc17Q9ESX4 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Zcchc17Q9ESX4 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Zcchc17Q9ESX4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Zcchc17Q9ESX4 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Zcchc17Q9ESX4 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Zcchc17Q9ESX4 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Zcchc17Q9ESX4 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Zcchc17Q9ESX4 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Zcchc17Q9ESX4 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Zcchc17Q9ESX4 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Zcchc17Q9ESX4 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Zcchc17Q9ESX4 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Zcchc17Q9ESX4 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Zcchc17Q9ESX4 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Zcchc17Q9ESX4 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Zcchc17Q9ESX4 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Zcchc17Q9ESX4 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Zcchc17Q9ESX4 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Zcchc17Q9ESX4 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Zcchc17Q9ESX4 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Zcchc17Q9ESX4 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Zcchc17Q9ESX4 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Zcchc17Q9ESX4 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Zcchc17Q9ESX4 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Zcchc17Q9ESX4 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Zcchc17Q9ESX4 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Zcchc17Q9ESX4 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Zcchc17Q9ESX4 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Zcchc17Q9ESX4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Zcchc17Q9ESX4 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Zcchc17Q9ESX4 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Zcchc17Q9ESX4 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Zcchc17Q9ESX4 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Zcchc17Q9ESX4 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Zcchc17Q9ESX4 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Zcchc17Q9ESX4 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Zcchc17Q9ESX4 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Zcchc17Q9ESX4 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Zcchc17Q9ESX4 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Zcchc17Q9ESX4 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Zcchc17Q9ESX4 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Zcchc17Q9ESX4 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Zcchc17Q9ESX4 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Zcchc17Q9ESX4 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Zcchc17Q9ESX4 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Zcchc17Q9ESX4 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Zcchc17Q9ESX4 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Zcchc17Q9ESX4 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Zcchc17Q9ESX4 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Zcchc17Q9ESX4 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Zcchc17Q9ESX4 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Zcchc17Q9ESX4 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Zcchc17Q9ESX4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms