Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQG9

Col4a3bp, Collagen type IV alpha-3-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3bpQ9EQG9 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Col4a3bpQ9EQG9 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Col4a3bpQ9EQG9 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Col4a3bpQ9EQG9 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Col4a3bpQ9EQG9 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Col4a3bpQ9EQG9 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Col4a3bpQ9EQG9 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Col4a3bpQ9EQG9 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Col4a3bpQ9EQG9 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Col4a3bpQ9EQG9 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Col4a3bpQ9EQG9 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Col4a3bpQ9EQG9 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Col4a3bpQ9EQG9 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Col4a3bpQ9EQG9 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Col4a3bpQ9EQG9 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Col4a3bpQ9EQG9 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Col4a3bpQ9EQG9 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Col4a3bpQ9EQG9 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Col4a3bpQ9EQG9 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Col4a3bpQ9EQG9 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Col4a3bpQ9EQG9 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Col4a3bpQ9EQG9 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Col4a3bpQ9EQG9 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Col4a3bpQ9EQG9 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Col4a3bpQ9EQG9 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Col4a3bpQ9EQG9 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Col4a3bpQ9EQG9 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Col4a3bpQ9EQG9 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Col4a3bpQ9EQG9 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Col4a3bpQ9EQG9 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Col4a3bpQ9EQG9 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Col4a3bpQ9EQG9 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Col4a3bpQ9EQG9 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Col4a3bpQ9EQG9 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Col4a3bpQ9EQG9 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Col4a3bpQ9EQG9 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Col4a3bpQ9EQG9 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Col4a3bpQ9EQG9 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Col4a3bpQ9EQG9 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Col4a3bpQ9EQG9 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Col4a3bpQ9EQG9 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Col4a3bpQ9EQG9 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Col4a3bpQ9EQG9 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Col4a3bpQ9EQG9 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Col4a3bpQ9EQG9 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Col4a3bpQ9EQG9 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Col4a3bpQ9EQG9 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Col4a3bpQ9EQG9 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Col4a3bpQ9EQG9 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Col4a3bpQ9EQG9 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Col4a3bpQ9EQG9 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Col4a3bpQ9EQG9 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Col4a3bpQ9EQG9 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Col4a3bpQ9EQG9 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Col4a3bpQ9EQG9 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Col4a3bpQ9EQG9 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Col4a3bpQ9EQG9 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Col4a3bpQ9EQG9 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Col4a3bpQ9EQG9 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Col4a3bpQ9EQG9 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Col4a3bpQ9EQG9 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Col4a3bpQ9EQG9 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Col4a3bpQ9EQG9 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Col4a3bpQ9EQG9 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Col4a3bpQ9EQG9 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Col4a3bpQ9EQG9 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Col4a3bpQ9EQG9 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Col4a3bpQ9EQG9 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Col4a3bpQ9EQG9 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Col4a3bpQ9EQG9 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Col4a3bpQ9EQG9 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Col4a3bpQ9EQG9 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Col4a3bpQ9EQG9 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Col4a3bpQ9EQG9 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Col4a3bpQ9EQG9 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Col4a3bpQ9EQG9 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Col4a3bpQ9EQG9 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Col4a3bpQ9EQG9 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Col4a3bpQ9EQG9 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Col4a3bpQ9EQG9 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Col4a3bpQ9EQG9 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Col4a3bpQ9EQG9 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Col4a3bpQ9EQG9 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Col4a3bpQ9EQG9 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Col4a3bpQ9EQG9 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Col4a3bpQ9EQG9 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Col4a3bpQ9EQG9 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Col4a3bpQ9EQG9 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Col4a3bpQ9EQG9 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Col4a3bpQ9EQG9 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Col4a3bpQ9EQG9 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Col4a3bpQ9EQG9 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Col4a3bpQ9EQG9 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Col4a3bpQ9EQG9 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Col4a3bpQ9EQG9 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Col4a3bpQ9EQG9 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Col4a3bpQ9EQG9 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Col4a3bpQ9EQG9 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Col4a3bpQ9EQG9 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Col4a3bpQ9EQG9 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms