Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ08

Sgsh, Heparan N-sulfatase, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgshQ9EQ08 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SgshQ9EQ08 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SgshQ9EQ08 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SgshQ9EQ08 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SgshQ9EQ08 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SgshQ9EQ08 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SgshQ9EQ08 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SgshQ9EQ08 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SgshQ9EQ08 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SgshQ9EQ08 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SgshQ9EQ08 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SgshQ9EQ08 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SgshQ9EQ08 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SgshQ9EQ08 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SgshQ9EQ08 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SgshQ9EQ08 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SgshQ9EQ08 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SgshQ9EQ08 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SgshQ9EQ08 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SgshQ9EQ08 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SgshQ9EQ08 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SgshQ9EQ08 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SgshQ9EQ08 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SgshQ9EQ08 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SgshQ9EQ08 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SgshQ9EQ08 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SgshQ9EQ08 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SgshQ9EQ08 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SgshQ9EQ08 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SgshQ9EQ08 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SgshQ9EQ08 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SgshQ9EQ08 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SgshQ9EQ08 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SgshQ9EQ08 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SgshQ9EQ08 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SgshQ9EQ08 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SgshQ9EQ08 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SgshQ9EQ08 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SgshQ9EQ08 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SgshQ9EQ08 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SgshQ9EQ08 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SgshQ9EQ08 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SgshQ9EQ08 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SgshQ9EQ08 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SgshQ9EQ08 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SgshQ9EQ08 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SgshQ9EQ08 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SgshQ9EQ08 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SgshQ9EQ08 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SgshQ9EQ08 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SgshQ9EQ08 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SgshQ9EQ08 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SgshQ9EQ08 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SgshQ9EQ08 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SgshQ9EQ08 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SgshQ9EQ08 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SgshQ9EQ08 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SgshQ9EQ08 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SgshQ9EQ08 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SgshQ9EQ08 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SgshQ9EQ08 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SgshQ9EQ08 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SgshQ9EQ08 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SgshQ9EQ08 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SgshQ9EQ08 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SgshQ9EQ08 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SgshQ9EQ08 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SgshQ9EQ08 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SgshQ9EQ08 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SgshQ9EQ08 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SgshQ9EQ08 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SgshQ9EQ08 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SgshQ9EQ08 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SgshQ9EQ08 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SgshQ9EQ08 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SgshQ9EQ08 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SgshQ9EQ08 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SgshQ9EQ08 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SgshQ9EQ08 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SgshQ9EQ08 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SgshQ9EQ08 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SgshQ9EQ08 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SgshQ9EQ08 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SgshQ9EQ08 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SgshQ9EQ08 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SgshQ9EQ08 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SgshQ9EQ08 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SgshQ9EQ08 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SgshQ9EQ08 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SgshQ9EQ08 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SgshQ9EQ08 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SgshQ9EQ08 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SgshQ9EQ08 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SgshQ9EQ08 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SgshQ9EQ08 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SgshQ9EQ08 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SgshQ9EQ08 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SgshQ9EQ08 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SgshQ9EQ08 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SgshQ9EQ08 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms