Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPW9

Tlr6, Toll-like receptor 6, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr6Q9EPW9 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tlr6Q9EPW9 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tlr6Q9EPW9 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tlr6Q9EPW9 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tlr6Q9EPW9 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tlr6Q9EPW9 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tlr6Q9EPW9 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tlr6Q9EPW9 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tlr6Q9EPW9 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tlr6Q9EPW9 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tlr6Q9EPW9 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tlr6Q9EPW9 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tlr6Q9EPW9 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tlr6Q9EPW9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tlr6Q9EPW9 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tlr6Q9EPW9 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tlr6Q9EPW9 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tlr6Q9EPW9 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tlr6Q9EPW9 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tlr6Q9EPW9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tlr6Q9EPW9 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tlr6Q9EPW9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tlr6Q9EPW9 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tlr6Q9EPW9 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tlr6Q9EPW9 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tlr6Q9EPW9 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tlr6Q9EPW9 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tlr6Q9EPW9 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tlr6Q9EPW9 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tlr6Q9EPW9 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tlr6Q9EPW9 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tlr6Q9EPW9 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tlr6Q9EPW9 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tlr6Q9EPW9 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tlr6Q9EPW9 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tlr6Q9EPW9 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tlr6Q9EPW9 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Tlr6Q9EPW9 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Tlr6Q9EPW9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tlr6Q9EPW9 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tlr6Q9EPW9 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tlr6Q9EPW9 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tlr6Q9EPW9 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tlr6Q9EPW9 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tlr6Q9EPW9 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tlr6Q9EPW9 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tlr6Q9EPW9 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tlr6Q9EPW9 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tlr6Q9EPW9 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tlr6Q9EPW9 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tlr6Q9EPW9 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tlr6Q9EPW9 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tlr6Q9EPW9 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tlr6Q9EPW9 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tlr6Q9EPW9 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tlr6Q9EPW9 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tlr6Q9EPW9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tlr6Q9EPW9 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tlr6Q9EPW9 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tlr6Q9EPW9 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tlr6Q9EPW9 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tlr6Q9EPW9 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tlr6Q9EPW9 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tlr6Q9EPW9 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tlr6Q9EPW9 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tlr6Q9EPW9 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tlr6Q9EPW9 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tlr6Q9EPW9 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tlr6Q9EPW9 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tlr6Q9EPW9 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tlr6Q9EPW9 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tlr6Q9EPW9 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tlr6Q9EPW9 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Tlr6Q9EPW9 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tlr6Q9EPW9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tlr6Q9EPW9 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tlr6Q9EPW9 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tlr6Q9EPW9 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tlr6Q9EPW9 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tlr6Q9EPW9 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tlr6Q9EPW9 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tlr6Q9EPW9 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tlr6Q9EPW9 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tlr6Q9EPW9 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Tlr6Q9EPW9 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tlr6Q9EPW9 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tlr6Q9EPW9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tlr6Q9EPW9 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tlr6Q9EPW9 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tlr6Q9EPW9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tlr6Q9EPW9 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tlr6Q9EPW9 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tlr6Q9EPW9 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Tlr6Q9EPW9 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tlr6Q9EPW9 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tlr6Q9EPW9 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tlr6Q9EPW9 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tlr6Q9EPW9 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Tlr6Q9EPW9 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tlr6Q9EPW9 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms