Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBR1

Xrn2, 5'-3' exoribonuclease 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrn2Q9DBR1 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Xrn2Q9DBR1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Xrn2Q9DBR1 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Xrn2Q9DBR1 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Xrn2Q9DBR1 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Xrn2Q9DBR1 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Xrn2Q9DBR1 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Xrn2Q9DBR1 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Xrn2Q9DBR1 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Xrn2Q9DBR1 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Xrn2Q9DBR1 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Xrn2Q9DBR1 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Xrn2Q9DBR1 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Xrn2Q9DBR1 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Xrn2Q9DBR1 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Xrn2Q9DBR1 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Xrn2Q9DBR1 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Xrn2Q9DBR1 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Xrn2Q9DBR1 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Xrn2Q9DBR1 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Xrn2Q9DBR1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Xrn2Q9DBR1 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Xrn2Q9DBR1 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Xrn2Q9DBR1 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Xrn2Q9DBR1 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Xrn2Q9DBR1 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Xrn2Q9DBR1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Xrn2Q9DBR1 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Xrn2Q9DBR1 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Xrn2Q9DBR1 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Xrn2Q9DBR1 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Xrn2Q9DBR1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Xrn2Q9DBR1 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Xrn2Q9DBR1 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Xrn2Q9DBR1 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Xrn2Q9DBR1 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Xrn2Q9DBR1 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Xrn2Q9DBR1 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Xrn2Q9DBR1 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Xrn2Q9DBR1 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Xrn2Q9DBR1 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Xrn2Q9DBR1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Xrn2Q9DBR1 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Xrn2Q9DBR1 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Xrn2Q9DBR1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Xrn2Q9DBR1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Xrn2Q9DBR1 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Xrn2Q9DBR1 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Xrn2Q9DBR1 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Xrn2Q9DBR1 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Xrn2Q9DBR1 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Xrn2Q9DBR1 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Xrn2Q9DBR1 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Xrn2Q9DBR1 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Xrn2Q9DBR1 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Xrn2Q9DBR1 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Xrn2Q9DBR1 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Xrn2Q9DBR1 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Xrn2Q9DBR1 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Xrn2Q9DBR1 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Xrn2Q9DBR1 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Xrn2Q9DBR1 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Xrn2Q9DBR1 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Xrn2Q9DBR1 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Xrn2Q9DBR1 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Xrn2Q9DBR1 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Xrn2Q9DBR1 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Xrn2Q9DBR1 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Xrn2Q9DBR1 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Xrn2Q9DBR1 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Xrn2Q9DBR1 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Xrn2Q9DBR1 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Xrn2Q9DBR1 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Xrn2Q9DBR1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Xrn2Q9DBR1 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Xrn2Q9DBR1 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Xrn2Q9DBR1 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Xrn2Q9DBR1 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Xrn2Q9DBR1 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Xrn2Q9DBR1 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Xrn2Q9DBR1 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Xrn2Q9DBR1 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Xrn2Q9DBR1 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Xrn2Q9DBR1 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Xrn2Q9DBR1 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Xrn2Q9DBR1 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Xrn2Q9DBR1 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Xrn2Q9DBR1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Xrn2Q9DBR1 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Xrn2Q9DBR1 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Xrn2Q9DBR1 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Xrn2Q9DBR1 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Xrn2Q9DBR1 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Xrn2Q9DBR1 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Xrn2Q9DBR1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Xrn2Q9DBR1 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Xrn2Q9DBR1 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Xrn2Q9DBR1 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Xrn2Q9DBR1 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Xrn2Q9DBR1 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 134.3 ms